樊毅，字智烈。南阳郡湖阳县（治今河南唐河西南湖阳镇）人，南朝梁、南朝陈将领。南梁散骑常侍、信武将军、益州刺史樊文炽之子。
樊毅出身将门，少习武，善骑射。侯景之乱时，随叔父樊文皎率部曲援救建康台城。樊文皎在青溪阵亡，樊毅率一族子弟到达江陵，隶属于王僧辩，讨伐河东王萧誉。以功绩任假节、威戎将军、右中郎将。
代其兄樊俊为梁兴郡太守，兼三州游军，随宜丰侯萧循讨湘州陆纳。到达巴陵，安营未整，陆纳夜袭，萧循大军混乱，军情危急时，樊毅指挥若定，身先士卒，与敌肉搏，奋战斩杀十余人，平定混乱。以功绩受位持节、通直散骑常侍、贞威将军，封夷道县伯。担任天门郡太守，进爵为侯。西魏军包围江陵，樊毅率兵救援江陵，江陵陷落，樊毅被岳阳王萧詧擒获。久后逃回。
南陈建立，樊毅和弟弟樊猛响应王琳起兵。王琳战败，樊毅随王琳奔北齐，南陈太尉侯瑱派使者招降樊毅，樊毅率子弟、部曲归顺陈朝。561年（天嘉二年），受位通直散骑常侍，随侯瑱攻打巴州、湘州，累进武州刺史。569年（太建元年），转任丰州刺史，封高昌县侯。入朝为左卫将军。573年（太建五年）、陈军北伐，樊毅率兵攻下广陵楚子城。在颍口击破北齐军，在沧陵击破北齐援军。575年（太建七年）攻下潼州、下邳、高栅六城。吕梁之战陈军战败，樊毅为大都督，进平北将军，率兵渡淮水，面对清口筑城，与北周军对峙。连绵之雨使城墙毁坏，樊毅全军撤退。转任中领军。579年（太建十一年），北周梁士彦率兵包围寿阳，樊毅为都督北讨诸军事，率水军入焦湖。担任镇西将军、都督荆郢巴武四州水陆诸军事。580年（太建十二年），进位督沔汉诸军事，因公务原因免官。581年（太建十三年），召还任中护军。出任护军将军、荆州刺史。
582年（太建十四年），陈后主即位，进位征西将军，改封逍遥郡公。入朝为侍中、护军将军。589年（祯明三年）隋军渡长江，樊毅建议仆射袁宪，在京口、采石要地布置精锐、加强防守，诸将赞成。施文庆封锁隋军情报，樊毅的作战计划没有实行。建康陷落后，南陈灭亡，樊毅入关中，不久去世。
