黄玉书（1844年－1889年），又名毓堂，字瑞符，号笏庭，台湾彰化鹿港人，祖籍泉州晋江壁谷乡。黄玉书曾补县学生员，后于光绪二年（1876年）考中举人，光绪己丑年（1889年），赴北京参加会试，再度中试，但因家事所连累，因此先行返台，无法继续参加殿试，连带导致其无法获取进士资格。
黄家祖先于康熙年间从福建泉州晋江壁谷乡渡海来台，开台祖与二世祖皆为邑庠生，原本居于草港，黄玉书之父黄英祥始迁居至鹿港泉州街。黄英祥与妻子许密娘育有4子，分别是黄毓庆、黄毓丁、黄毓堂和黄毓衡，三子黄毓堂即为黄玉书。
黄玉书自幼家贫，但聪颖好学，在弱冠时补县学生员，于岁试时屡屡获取优等成绩。光绪元年（1875年），适为恩榜，翌年赴福州参加乡试中举。
光绪十三年（1887年）台湾建省。他与彰化仕绅蔡德芳、庄士勋、吴德功、吴鸿宾、郑茂松、吴朝阳、吴恩波、黄炳奎、刘凤翔、郑景奇等22人共同联署“建省会于鹿港议”，希望台湾巡抚刘铭传将省会择址于鹿港，写道：
窃台湾建省，近复蒙钦宪下驻，带率员绅就彰属内周历相度，择建省垣；远近闻风，争相顶祝，何事多生末议！顾念山川形胜，非耳目所能遽周；原隰询谋，即刍荛亦所不弃。爰敢佥据所知所闻，略举谨陈巅末。台湾一岛孤悬，南北绵亘千余里；东尽横山，西临瀚海。重以土浮民靡，动辄生变；无事则耕渔亦足相安，有事则请兵筹饷，在在仰需内地。伏思开台之初，建设郡、厅、县多从海口，意殆为是。独嘉义一县城离海稍远，每遇揭竿，四面受困；历征前事，可为寒心！至如彰化城，西离鹿港，不过十余里。其奈东延内山、平洋辽阔，伏莽滋扰；兼之溪多林杂，防御难施。即如同治元年戴逆自内一发，城池立陷；城之西面只一桥被断、一竹围被踞，虽内地大兵数千接屯鹿港，经年莫能前进。洎乎南北大兵夹击，收复后犹争。爰乾隆年间贵西道赵翼议移彰城于鹿港之说，恳恩入告，事虽未行；要其大意，总以设城距海越近越是也。今当盛朝，威灵震迭，欣荷钦宪抚临此邦，营建省会；从此添兵足饷，重权镇摄，全台托庇，万万不至虑此。第圣人有言：“处常固当思变，谨始乃以慎终”。如果台湾得蒙建省，省会必归彰界；当谓重卫居中，藉可控制乎南北内外，诚我台阳千百年不易之宏规也。然恐前议县城移近于海者，今或将省城转而设于近山。万一地方有警，一溪扼险，万兵莫近；似乎咫尺先不能通，何论南北内外！此尤大势之不可不筹者也。至于来龙之归宿、海道之引通，或择其新地而深谋远虑，或仍其旧城而事半功倍；钦宪明见万里，斟酌自有权衡，无庸芳等多赘也。且事关奏闻，是非下士所能置辩。唯既生长于斯，见闻颇熟；抱此区区，又不能坐受“知而不言”之咎。爰敢沥据历来大局情形，附绘彰化旧城来龙宿脉图说一纸，恳乞转详。
此文由时任彰化县知县李嘉棠转呈至刘铭传，但立即被刘铭传以：“鹿港濒海，地势低下，水口沙浅，不能泊船……非为控制全台起见，特为本地贸易起色耳。统论全台局势，岂有弃中、南、北、前、后三千里地方，独重鹿港一镇之理！如以鹿港傍海易守，不致四面受敌；何以福建省城不立于长门、江苏省城不立于吴淞？查该绅士等始议建省必就彰化县城，继又禀在大墩地方，现又禀请于鹿港建省；侈然自大，随意指陈，直视台湾地方只有鹿港一镇最重、台湾绅士亦只有鹿港最大，殊属荒谬！省城形势，有关全台气运，必须相其阴阳、观其流泉。如择定处所或有凶砂恶水，来龙不真；或山水阴阳不交，不成格局：均可由地方绅士知堪舆者一一指驳。查大墩地方襟山带海，控制南北，实天造省会之基；本经岑宫保勘定建城，复经本爵部院上年亲往察看，堪建省城……禀请建省鹿港为私忘公，应毋庸议。”的理由遭到驳回。
光绪十二年（1886年）十二月十二日，湳底庄黄敏、黄汶丁兄弟三人率领党徒七、八十人，闯入童生黄玉衡家中抢劫，并绑架其长子黄坤元、次子黄坤连。官府曾派出许多人开导黄敏兄弟，希望能赎回人质，后命令黄玉书三次往谕，反复譬晓，但黄敏兄弟拒不释放人质。之后，武官蔡麟祥攻打湳底庄，村民亦相助攻击，终于将两子寻获。
光绪十四年（1888年）施九缎事件爆发。黄玉书私自进入彰化县城打听消息，但被李嘉棠围掳，乘夜逃出城内。后来，台湾布政使沈应奎命令彰化仕绅吴德功通知鹿港仕绅，到彰化县城会见。郑协台子开、蔡德芳、施家珍、施家藻、黄玉书、许肇清等人抵达县城。
光绪己丑年（1889年），赴北京参加礼部会试，再度中试，但因其弟黄毓衡病重，因此先行返台，无法继续参加殿试。之后，黄玉书被敕授为文林郎（为正七品官衔），晋封为承德郎（为正六品官衔）等职。黄毓衡在同年7月过世后，黄玉书也在10月初突然逝世。他的死因另有一说，指其因参与社头人分配祖产，当中有人诬告他裁理不公，而被毒死于家中，享年46岁。其墓位于今鹿港廖厝里澎湖厝，人称“黄进士墓”。
光绪年间，黄玉书担任员林兴贤书院山长（院长），辜显荣曾在8岁至20岁时受教于其门下，研读汉学。他在书院内的成绩名列前茅，令黄玉书惊叹万分。
黄玉书与其妻许匏娘育有4子，分别为：长子黄秀华（号继昌）、次子黄秀实（号继辉）、三子黄秀荣（号继忠）、四子黄秀恺（号继慈）；另外有一妾王狃，养育子孙有功。黄家子孙深受其教导影响，精通四书、古文，且黄秀荣曾在自家中办学。黄家族人于台湾日治初期由泉州街迁居至牛墟头，经营食盐配运及贩卖阿片烟（鸦片烟），以支付大家族的开销，1925年，黄家结束专卖事业，举家迁回泉州街祖厝。
1944年，正逢黄玉书一百岁冥诞，鹿港黄家为纪念此事，因而举行祭典，黄家族人也撰写了追悼文，其中黄玉书之妻舅许存奏写了一篇〈追悼先姊丈黄笏翁冥寿百岁祭典〉，内容叙述黄玉书之为人，并赞扬其科举功名以及其后代。
黄玉书之墓于光绪壬辰年（1892年）兴建，现位于鹿港澎湖厝地区的私人墓地内，当地居民称此墓为“黄进士墓”。坟墓为二曲手格局，墓碑上写着：
檗谷，光绪壬辰年葭月吉旦，皇清显考敕授文林郎、晋封承德郎，号笏庭黄府君墓，男四大房祀。
墓碑两旁有一个对联，写道：“檗石旧家声、澎湖新寿域”，后一句指此墓位于澎湖厝。曲手立柱上有石狮雕刻，墓碑上有碑额、碑身之石材，碑额上方刻着螭虎团以及寿字，是一座浅浮雕。
《台湾通志》一书将黄玉书纪作“光绪十五年进士”，但黄典权所著之〈清进士题名碑中之台湾进士〉一文，就没有将之列入其中。事实上，黄玉书仅在光绪十五年（1875年）参加会试及第，但因家事所连累，导致其无法参加殿试，连带无法取得进士资格。因此，黄玉书并不是一名进士，而是一位“贡士”。
