RaTG13病毒(BatCoV RaTG13)是乙型冠状病毒属一种感染蝙蝠的病毒,于2013年在中国云南的中菊头蝠体内被发现。此病毒为正链单股RNA病毒,具有外膜,其基因组长约29800nt,编码冠状病毒皆有的复制酶(1a/1b)和刺突蛋白(S)、膜蛋白(M)、外膜蛋白(E)与衣壳蛋白(N)等四种结构蛋白,以及NS3、NS6、NS7a、NS7b、NS8等五种辅助蛋白。
RaTG13病毒与造成2019冠状病毒病疫情的严重急性呼吸道症候群冠状病毒2型(SARS-CoV-2)亲缘关系接近,两者序列的相似度高达96.2%。不过两病毒刺突蛋白(S)受体结合位(RBD,即与宿主细胞表面受体结合造成感染的部分)差异较大,显示RaTG13病毒可能不是和SARS-CoV-2一样使用血管紧张素转化酶2(ACE2)为受体感染细胞。另外RaTG13病毒也不具有SARS-CoV-2刺突蛋白中S1与S2间可以被弗林蛋白酶(英语:furin)切割的PRRA序列。