祁熊佳（1608年2月3日－1673年9月25日），字非熊，又字文载，号师濂，浙江绍兴府山阴县人，明朝、南明政治人物。
祁熊佳是苏松总督祁彪佳的堂弟，崇祯九年（1636年）中式丙子科举人，崇祯十三年（1640年）登进士，获授南平县知县，催收革除火耗，命令民众将税款投入柜中，又淘汰索价守宿的船夫；迁兵科给事中。
弘光时，马士英以王之明假冒太子交付三法司审讯，借词诬陷黄澍、姜曰广为幕后主使。他当众说：“现在不知道太子真伪，若胡乱施加笞刑，如何令天下信服？如今朝廷老成凋落，又同时罗织冤狱，这样什么意思？”因此马士英终止此事；不久他也在朝廷选采女期间上疏千字奏章反对。
左良玉带兵讨伐马士英，征召祁熊佳，他说：“国贼马士英令神人共愤，我当然想亲手杀死他以谢天下，但将军带兵东向出师无名，恐怕难以服众。”左良玉不听，唯这番话令时人传诵。到鲁王朱以海监国，任命他监督张名振军队渡江；隆武帝改任改福建道御史，加尚宝司丞，升任左中允、侍读；福京沦陷后不再出仕。
