抑制震荡子

✍ dations ◷ 2025-12-11 16:01:57 #合成生物学

抑制震荡子(英语:Repressilator)是一个人工合成的基因调控网络。它是一个由三个基因组成的环形振荡器,其中的每个基因各自表达抑制蛋白并抑制下一个基因的表达。

Michael Elowitz和Stanislas Leibler在2000年最早发表了抑制震荡子。该网络的设计能够使绿色荧光蛋白的水平产生稳定的震荡,其作用与具有固定震荡周期的电子振荡器系统类似。通过标准的分子生物学方法,研究者在大肠杆菌中组建了这一网络,并通过观察证实了改造菌落具有期望中的振荡行为。

抑制震荡子由三个连成反馈环路的基因组成,其中每个基因抑制环路中的下一个基因,并被前一个基因抑制。另外,绿色荧光蛋白被用作系统的报告基因,使我们可以使用荧光显微镜观察网络的行为。

两个简单的数学模型指导了抑制震荡子的设计,其中一个是连续的和确定的,另一个是离散的和随机的。

通过分析这些数学模型,我们可以确定能够产生持续振荡的各种速率参数的值。研究者发现一些条件有利于振荡的发生,例如与高效核糖体结合位点偶联的强启动子,严格的转录抑制(低泄露),协同抑制以及较为接近的蛋白质和mRNA降解速率。

从这些分析中可以得出两个设计要点。

首先,为了减小泄漏,原有的启动子区被替换为更严格的混合启动子。这种混合启动子其结合了λP L 启动子与LACL和TetR的操纵序列。

第二,为了减少抑制蛋白和mRNA之间的寿命差异,每个抑制蛋白基因的3'末端都被添加了基于ssRA序列的末端标签。这种标签可以被蛋白酶识别,并引导蛋白酶降解被标记的蛋白质。

研究者使用了一种低拷贝质粒表达抑制震荡子,使用了另一种高拷贝的质粒表达报告基因。这两种质粒都需要被转化到大肠杆菌中。

抑制震荡子是合成生物学的里程碑,它证明可以通过人工设计实现表达期望功能的基因调控网络。此外,初期的实验使我们可以对许多生物体中发现的生物钟得出新的评价。这些生物钟往往比抑制剂表现得更强大。最近在RIKEN定量生物学中心进行的一项调查发现,单个蛋白质分子可以经由化学修饰形成与温度无关的自持振荡器。

抑制震荡子在数学上的应用可能有助于从昼夜节律到内分泌等领域的研究。通过对抑制震荡子的研究,我们能够更清楚的阐明自然生物系统中固有的同步性以及影响它们的因素。

2016年,一个研究团队大大提高了原始设计的准确性。  

相关

  • NaOH氢氧化钠,又称烧碱和苛性钠(sodium hydroxide;lye and caustic soda),化学式为NaOH,是一种具有高腐蚀性的强碱,一般为白色片状或颗粒,能溶于水生成碱性溶液,另也能溶解于甲醇及乙醇。
  • 姆斯季斯拉夫·克尔德什姆斯季斯拉夫·弗谢沃洛多维奇·克尔德什(俄语:Мстисла́в Все́володович Ке́лдыш,1911年1月28日(2月10日)-1978年6月24日)是数学家、物理学家、航天
  • CIsub4/sub四碘化碳、四碘甲烷(分子式:CI4),是四卤甲烷的一种,室温下为亮红色晶体,是少见的深色甲烷衍生物之一。其分子中仅含碳2%。四碘化碳分子为正四面体型,C-I键长为2.12±0.02Å,分子内I-
  • 台湾社会学会台湾社会学会(台湾社会学会,英语:Taiwanese Sociological Association)是台湾的社会学学术组织。成立于1930年成立于中国上海,前身为“中国社会学社”,系由孙本文、许仕廉等学者倡
  • 汉普斯特得坐标:51°33′15″N 0°10′28″W / 51.5541°N 0.1744°W / 51.5541; -0.1744汉普斯特德(Hampstead)是英国伦敦的一个区域,属于内伦敦卡姆登区的一部分,位于查令十字西北4英里(6.
  • 里坡里坡(1928年7月23日-2013年3月31日),原名李庆章,天津市宝坻县大口屯镇镇北村人,中国男演员。1928年农历六月十四日出生于宝坻县大口屯镇镇北村。原为工厂学徒,在北平加入塞声剧社,成
  • LPGA美国女子职业高尔夫协会(英文:Ladies Professional Golf Association,缩写:LPGA)是美国女子职业高尔夫球员的组织,总部位于代托纳比奇,最知名的就是该协会管理的美国女子职业高尔夫
  • 天骄天骄可以指:
  • 杰克·威兹德姆杰克·威兹德姆(英语:Jack Wisdom,1953年1月28日-),美国天文学家,麻省理工学院的行星科学教授。1976年,他获得了莱斯大学学士学位。1981年,他获得了加州理工学院博士学位。他的研究兴
  • 黎代黎代(Lide),是十五世纪时苏门答腊岛上的一个小国,位置在那孤儿国西面,在今印尼苗流株区(Meureudu)。南面背山,北临大海,西与南浡里国相邻,人口约二千户,推举一人为王。明朝永乐年间,三宝