贝冢，也称作贝丘，指的是由贝壳堆积形成的考古现象，其存在也显示着人群利用水生资源的生业模式。
作为弃置垃圾的现象，贝冢除了大量的贝壳之外，也常常发现弃置的陶片、石器、兽骨、鱼骨等。台湾的贝冢分布由南到北及离岛皆有所见，发现有贝冢的考古学文化包含南部大湖文化、中部番仔园文化、北部的十三行文化和圆山文化等；而连江县的亮岛岛尾考古遗址亦发现距今约8300-7000年前左右的贝冢。其中以圆山文化最为知名，也常被称为“贝冢文化”，广大深厚的贝冢在日治时期就被发现进而调查研究，其中也发现埋藏有人骨。同样发现埋藏有人骨的贝冢还包括亮岛岛尾考古遗址，发现的两具人骨保存良好，并且采集并建立有效基因序列，为近期重大发现之一。
贝冢富含碳酸钙，可以有效中和土壤酸性，形成的堆积环境减缓了人骨、兽骨等有机质风化腐烂的情形，提供考古学保存良好的研究素材。贝冢除了提供生业型态的观察之外，也能进一步利用贝壳进行种类分析，例如贝的种类生活环境为纯咸水、半咸水、纯淡水等，以获取饮食偏好、采集季节、环境建立等讯息。
在亚洲地区如日本，也有贝冢现象的分布，最早于1877年（明治10年）由美国动物学者摩斯（Edward Sylvester Morse）发现大森贝冢，发掘后出土贝壳、兽骨、陶器及石器等引发关注，同时因为日本首次学术性发掘而被称为“日本考古学发祥地”。在日本绳文时代早期可见，至弥生时代和古坟时代则属偶见。
