瓦片阵列

✍ dations ◷ 2024-09-20 08:38:09 #微阵列,计算生物学

瓦片阵列(英语:Tiling array,亦称为覆瓦阵列)是微阵列芯片中的一种子类型。类似于传统微阵列,瓦片阵列通过将标记的DNA或RNA靶分子杂交到固定在固体表面上的探针而发挥作用。

瓦片阵列与传统微阵列之间的不同之处在于探针的性质:瓦片阵列的探针并不是对散列在整个基因组中的已知或预测基因的序列进行探测,而是对连续区域内存在的已知序列进行密集地探测。这有助于表征已测序但功能却知之甚少的区域。瓦片阵列可用于:辅助转录物组作图、发现DNA/蛋白质相互作用(ChIP-chip和DamID)位点、DNA甲基化(MeDIP-chip)位点、DNA酶敏感(DNase Chip)位点及阵列比较基因组杂交。瓦片阵列除了可以检测之前未鉴定的基因及调控序列,还可能对转录产物进行深度定量。被称为“特征”的瓦片阵列单位中,特异性探针的拷贝数可上数百位(而在传统阵列中仅有少数几个),而密布在每张阵列上的特征数则在10,000到大于6,000,000个之多。可以通过调节探针与探针之间重叠的序列多少、探针序列间已知碱基的数量或探针长度而达到改变作图分辨率的目的。对于如拟南芥这样较小的基因组,瓦片阵列甚至可对全基因组进行探测。瓦片阵列是全基因组关联分析中应用的有力方法。

相关

  • 破伤风破伤风(英语:Tetanus/Lockjaw),俗称四六风、脐带风、七日风,因为在婴儿出生后4至6天,少数早至2天或迟至14天以上发病。当破损的皮肤或粘膜被感染,或新生儿由于切断脐带时被感染,破伤
  • 代谢物组学代谢物组学(英语:metabolomics)是涉及代谢产物的化学过程的科学研究。具体而言,代谢物组学是“对特定的细胞过程遗留下的特殊化学指纹的系统研究”,对它们的小分子代谢产物的整体
  • 郭劲宏郭劲宏(英语:George Ching-Hung Kuo),台湾裔病毒学家,1989年与迈克尔·霍顿、朱桂霖(英语:Qui-Lim Choo)和丹尼尔·布拉德利共同发现并成功培养了丙型肝炎病毒。在1970年代,医学界发
  • 亚利桑那红雀国家橄榄球联盟(1920年至今)联会冠军(1)分区冠军(7) NFL西区:亚利桑那红雀(英语:Arizona Cardinals)是一支位于亚利桑那州菲尼克斯近郊格兰岱尔的职业美式橄榄球球队。在2006年球季起
  • 伊瓜苏国家公园伊瓜苏国家公园(西班牙语:Parque Nacional Iguazú)是阿根廷的一座国家公园,位于米西奥内斯省北部阿根廷和巴西的交界处,面积550km2。1984年,联合国教科文组织将其列入世界遗产。
  • 果子狸属Gulo larvara Hamilton-Smith, 1827果子狸(学名:Paguma larvata)又名花面狸、白鼻心、果子猫(台湾话:.mw-parser-output .sans-serif{font-family:-apple-system,BlinkMacSystemF
  • 脂壁酸脂壁酸或称为脂磷壁酸(英语: Lipoteichoic acid),简写为 LTA,是菌体细胞壁的成分之一,由重复性的甘油磷酸 (glycerophosphate, GroP) 骨架组合而成,上面键结许多糖脂 (glycolipid)
  • 印度穿山甲印度穿山甲(学名:),是穿山甲科穿山甲属的一个物种。印度穿山甲主要分布于印度及斯里兰卡的大部分地区。印度穿山甲跟一般穿山甲同样,身上遍布大型的覆盖鳞片,充当护身的甲胄。它亦
  • 金俊渊金俊渊(朝鲜语:김준연,1895年3月14日-1971年12月31日)是韩国独立运动家和政治人。第三任朝鲜共产党首,首任·3~5任大韩民国国会议员,号朗山(낭산)。日本留学后1920年到东京大学法独
  • 物候学物候学(英语:phenology 源于希腊文:phainomai(φαινομαι-显示、见现))为研究气候与生态事件(特指生物的某现象)互相时间关系之学问。这门科学主要关心生物事件之变化在年循