瓦片阵列

✍ dations ◷ 2025-10-24 18:39:17 #微阵列,计算生物学

瓦片阵列(英语:Tiling array,亦称为覆瓦阵列)是微阵列芯片中的一种子类型。类似于传统微阵列,瓦片阵列通过将标记的DNA或RNA靶分子杂交到固定在固体表面上的探针而发挥作用。

瓦片阵列与传统微阵列之间的不同之处在于探针的性质:瓦片阵列的探针并不是对散列在整个基因组中的已知或预测基因的序列进行探测,而是对连续区域内存在的已知序列进行密集地探测。这有助于表征已测序但功能却知之甚少的区域。瓦片阵列可用于:辅助转录物组作图、发现DNA/蛋白质相互作用(ChIP-chip和DamID)位点、DNA甲基化(MeDIP-chip)位点、DNA酶敏感(DNase Chip)位点及阵列比较基因组杂交。瓦片阵列除了可以检测之前未鉴定的基因及调控序列,还可能对转录产物进行深度定量。被称为“特征”的瓦片阵列单位中,特异性探针的拷贝数可上数百位(而在传统阵列中仅有少数几个),而密布在每张阵列上的特征数则在10,000到大于6,000,000个之多。可以通过调节探针与探针之间重叠的序列多少、探针序列间已知碱基的数量或探针长度而达到改变作图分辨率的目的。对于如拟南芥这样较小的基因组,瓦片阵列甚至可对全基因组进行探测。瓦片阵列是全基因组关联分析中应用的有力方法。

相关

  • 心内膜炎心内膜炎(英语:Endocarditis)是心脏的心内膜(心腔中的最深层的组织)引发的炎症,通常和心脏瓣膜有关。此外,心内膜炎也可能与室间隔(英语:interventricular septum)、腱索(英语:chordae t
  • 马来半岛马来半岛(英语:Malay Peninsula,马来语:Semenanjung Tanah Melayu)位于亚洲大陆最南端,是东南亚中南半岛的一个主要半岛,与苏门答腊岛隔着马六甲海峡,是为太平洋和印度洋的分界线。
  • 醌是含有共轭环己二烯二酮或环己二烯二亚甲基结构的一类有机化合物的总称。大部分的醌都是α,β-不饱和酮,且为非芳香、有颜色的化合物。最简单的醌是苯醌,包括对苯醌(1,4-苯醌
  • 重摄取抑制剂再摄取抑制剂 (英语:reuptake inhibitor)(RI)是一种再摄取调节剂(英语:reuptake modulator),它可抑制由细胞膜转运体中介的神经传导物再摄取(英语:reuptake),进而增加胞膜外神经传导
  • 大麻使用障碍大麻使用障碍(英语:Cannabis use disorder,缩写CUD),又称大麻依赖或大麻成瘾、大麻上瘾、大麻瘾,是指因吸食大麻或使用大麻的主要精神活性物质四氢大麻酚(THC)所产生的以心理依赖(意
  • 日本猕猴日本猕猴(学名:Macaca fuscata),也叫雪猴,是生活在日本北部的一种猕猴。它们是世界上生活地区最北(最北达到本州青森县北部下北半岛)的非人类灵长目动物。日本猕猴的毛色为灰褐色,脸
  • 观音山《观音山》(英语:Buddha Mountain)是一部2011年上映的中国文艺剧情片,由李玉执导,张艾嘉、陈柏霖及范冰冰联袂主演。表达的主题是探讨青春成长、生命归宿和爱情条件。此电影有两
  • 新奥尔良有轨电车新奥尔良有轨电车(英语:Streetcars in New Orleans)是美国路易斯安那州新奥尔良市的有轨电车,由新奥尔良地区交通局运营。该系统有三条线路,总长19千米(11.81英里) ,日客流量1.9万人
  • 小沙沙漠小沙沙漠(Little Sandy Desert)位于澳大利亚西澳大利亚州,位于大沙沙漠以南,吉布森沙漠以西。因与大沙沙漠相邻、相似,但面积较小,从而得名“小沙沙漠”。它与大沙沙漠在地形地貌
  • 7SENSES7SENSES是中国女子偶像团体SNH48的一个主打青春潮流歌舞的国际化小分队,以欧美风格为主,团体成立发布于2016年4月20日,由赵粤、孔肖吟、戴萌、许杨玉琢、许佳琪、陈琳、张语格7