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第一例2019冠状病毒病疫情于2020年1月27日在柬埔寨出现。
1月27日下午3时、第一例病例在西哈努克省维尔得到确认、一名60岁中国男子、他于1月23日与家人从武汉市抵达。他的其他三名家庭成员由于没有出现症状而被隔离、而他被安置在柏西哈努克转诊医院的一间单独的房间里。
2月10日卫生部表示，经过两周以来的观察和治疗，该患者在柬埔寨巴斯德研究所第三次核酸检测中检测结果呈阴性，已经完全康复。患者出院后第二天乘飞机去往西哈努克市，与他同程的还有80位中国公民。尽管武汉仍处于检疫状态，但大多数人此后已返回中国。
5月16日卫生部公布最后一位在诊中患者的第二次核酸检测为阴性而出院，柬埔寨122宗病例完全治愈，连续34天无新增确诊病例。
5月21日卫生部发宣布有一名新患者曾在菲律宾旅游，并将62位同航乘客在金边一间酒店实行隔离。
2月20日，柬埔寨首相洪森证实当日有32例新增确诊，大部分为中国公民。这是该国爆发的第三次社区传播，当地称之为“2.20”事件。这次爆发源于有四名在首都金边的酒店隔离的中国公民贿赂酒店保安，违规逃离隔离酒店。事发后，酒店所在的钻石岛已被封锁隔离。
此后，柬埔寨新冠确诊病例数激增。3月12日，柬埔寨出现首例死亡病例。为应对该次爆发，柬埔寨政府已关闭全国的大型公共场所，并于4月7日至20日期间禁止人员跨省流动。金边从4月1日起实施宵禁，预计为期四周。此外金边和干丹省的达克茂市从4月15日起将封城两周。
