上海申花足球俱乐部2012赛季是上海申花足球俱乐部在中超的第九个赛季，也是第31次征战中国最高级别的足球联赛，俱乐部也将参加2012年中国足协杯。
2012赛季开赛前，上海申花俱乐部大手笔地引进了法国球星尼古拉·阿内尔卡与法国名帅让·蒂加纳，使得球队的联赛夺冠呼声甚至超过了卫冕冠军广州恒大。
2011年12月12日，上海申花队与前切尔西前锋尼古拉·阿内尔卡签约两年，并于2012年2月与球队在西班牙集训期间汇合。一周后的2011年12月19日，法国足球名宿让·蒂加纳成为球队的新任主教练。季前赛，球队分别在昆明海埂与西班牙巴伦西亚进行了集训。
赛季初，球队外援以引进前锋为主，除了阿内尔卡外，申花还从后来的2011-12赛季英冠冠军球队雷丁租借了法国籍强力黑人前锋马蒂厄·曼塞、从联赛死敌北京国安挖来了澳大利亚籍主力前锋乔尔·格里菲斯，中场引进了波黑前国脚马里奥·波西奇，后防线则买入了巴西球员莫伊塞斯。
2012年赛季开始前，2003年在闸北建队的南昌恒源（原上海衡源足球俱乐部）宣布将主场回迁上海，并冠名南昌衡源足球俱乐部上海申鑫队，使得上海时隔五年再次出现了两支顶级联赛球队。2月25日，上海申鑫在赛季前与上海申花的热身赛中，球队上海籍球员王赟与申花后卫戴琳发生争执，并最终引发双方球员群殴的情况，成为媒体一度关注的焦点，该场热身赛也就此取消。
2012年4月15日晚，由于球队战绩不佳以及与俱乐部高层矛盾激化，任职仅5个月的主教练让·蒂加纳正式向上海申花俱乐部提出辞呈。球队助理教练让·弗洛伦特·伊本吉成为代理主教练，阿内尔卡成为球队队长兼助理教练。
2012年5月30日晚，上海申花队宣布前阿根廷国家队主教练塞尔吉奥·巴蒂斯塔成为申花队主教练，这也是一个赛季中申花调换的第三任主教练。
在中超间歇期举办的2012上海国际足球邀请赛中，上海申花与上海申鑫队以东道主球队身份参加。在两轮制的比赛中，申花先后1-1战平由19到27岁的业余球员组成的阿根廷CN竞技、1-3输给南非足球超级联赛球队莫罗卡燕子，最终排名第三，上海申鑫队夺得赛事冠军。
2012年6月20日，英超豪门切尔西的当家球星迪迪埃·德罗巴通过自己的官方网站宣布了加盟申花的消息，成为阿内尔卡后同一赛季中上海申花引进的又一位国际巨星。2012年7月22日，中超第18轮的比赛中德罗巴完成了其在申花队的首秀并完成一次助攻，帮助球队1-1战平了广州富力。在德罗巴以及同样在联赛中期加盟的哥伦比亚国脚吉奥瓦尼·莫雷诺帮助下次，上海申花成绩出现了反弹，联赛保持11轮不败（4胜7平），联赛排名升至第8名，在联赛还剩4轮的情况下，依然保有冲击亚冠资格的机会。
2012年10月6日，联赛第27轮上海申花南下挑战贵州人和，球队在场面上得势不得分，最终2-4惨败，也宣告了申花队该赛季的亚冠梦提前破灭。随后，申花又在主场1-3败给了长春亚泰，0-0平了大连阿尔滨，联赛排名降至第11名。2012年11月3日，上海申花在联赛最后一轮比赛中3-0击败了提前保级成功的青岛中能，以联赛第9名收场。
2012赛季的中超联赛竞争十分激烈，在联赛还剩两轮之时，呈现出了2队争冠，6队争亚冠，7队保级的局面，唯独只有上海申花既无争亚冠资格，也无降级之忧。
注释：国旗表示球员在国际足联资格规则定义的国家队。球员可能拥有一个以上非国际足联国籍。
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最后更新： 2012年12月4日.
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