2008–09年欧洲冠军联赛是第 54 届的欧洲冠军联赛赛事。本届决赛于2009年5月27日，在意大利罗马的罗马奥林匹克体育场举行。冠军由巴塞罗那夺得，他们在决赛以 2–0 净胜曼联，历来第 3 次夺标；同时巴塞罗那亦继曼联于 1999–00 赛季后，第二支球队能于季内成为“三冠王”伟业。
第一圈外围赛：（28 队）
第二圈外围赛：（28 队）
第三圈外围赛：（32 队）
分组赛：（32 队）
在2008年6月4日，2007 / 08 赛季葡超冠军波尔图被葡萄牙足球总会裁定不承认他们这季的成绩，事缘因他们在 2003 / 04 赛季中向球证行贿，以作为惩罚。正因如此，吉马良斯便能借此由原本需要参加本赛事之第三圈外围赛，晋升到直接进入分组赛阶段；而本菲卡亦能由原本只能参加欧洲联盟杯变成于欧洲冠军联赛角逐。
但其后波尔图提出上诉，欧洲足球协会（UEFA）介入事件当中，欧足联人员于会议中将事件重新评定，最后得到的结果刚好与之前判决相反，他们批准了波尔图能够参与本届欧联赛事。
2007 / 08 赛季保加利亚超联冠军索菲亚中央陆军由于债务上出现了问题，欧洲足球协会（UEFA）基于安全问题而取消了索菲亚中央陆军的参资格。同时会由联赛第 2 名的索菲亚利夫斯基取代中央陆军的位置，出战本赛事的第三圈外围赛。
以下的日期表列出了各圈赛事及抽签仪式的举行日期。
第一圈外围赛抽签仪式于2008年7月1日位于瑞士尼庸的欧足联总部进行。首回合于2008年7月15及16日进行，次回合则于7月22及23日进行。
此圈首回合赛事会于7月29日及7月30日进行，而次回合会于8月5日及8月6日进行。
第三圈外围赛之抽签仪式在2008年8月1日于瑞士尼庸举行。此圈首回合赛事会于8月12日及8月13日进行，而次回合会于8月26日及8月27日进行。
总数 32 球队会被分成 8 组，每组 4 队参加分组赛。每组首名及次名均晋级十六强淘汰赛，第三名则转战欧洲联盟杯三十二强淘汰赛继续参与欧洲赛事。
如在小组中两队得分相同则顺次序根据以下准则定出胜方：
^ 注解1：由于马德里竞技的球迷于首场主场对马赛的赛事中，涉嫌种族歧视对手球迷，因此该会被欧足联禁止于欧洲赛中使用其主球场（比森特·卡尔德隆球场）3 次，当中第三场禁赛缓刑期五年执行；意即马德里竞技余下两场的欧联分组赛主场（分别对利物浦及PSV埃因霍温）赛事需改于中立场上演。然而，发出这通知与正式比赛日期两者相距之时间过少，导致各方面未能协调，因此欧足联决定暂时延迟对马德里竞技之处罚，并于10月31日再次进行审判。结果，欧足联最终判马德里竞技无需于中立场比赛，但小组赛第 5 轮主场对PSV埃因霍温则需闭门作赛。
十六强抽签仪式在2008年12月19日于瑞士尼翁的欧足联总会内举行。十六强首回合赛事于2009年2月24日／25日进行，次回合赛事于2009年3月10日／11日进行。
半准决赛抽签仪式在2009年3月20日于瑞士尼翁的欧足联总会内举行。半准决赛首回合赛事于2009年4月7日／8日进行，次回合赛事于2009年4月14日／15日进行。
准决赛抽签仪式在2009年3月20日与半准决赛一并举行。准决赛首回合赛事于2009年4月28日／29日进行，次回合赛事于2009年5月5日／6日进行。
决赛会于2009年5月27日上演，比赛场地于意大利罗马的罗马奥林匹克体育场举行。
巴塞罗那 
v 
曼联
冠军
巴塞罗那
亚军
曼联
准决赛
阿森纳 •切尔西
半准决赛出局
拜仁慕尼黑 •利物浦 •波尔图 •比利亚雷亚尔
十六强出局
马德里竞技 •国际米兰 •尤文图斯 •里昂
帕纳辛奈科斯 •皇家马德里 •罗马 •葡萄牙体育
分组赛出局
奥尔堡 •阿诺索西斯 •巴塞尔 •贝特 •波尔多 •凯尔特人 •克卢日 •基辅迪纳摩 •费内巴切
佛罗伦萨 •马赛 •PSV埃因霍温 •顿涅茨克矿工 •布加勒斯特星队 •云达不来梅 • 泽尼特
第三圈外围赛出局
帕沙卡 •布兰 •加拉塔萨雷 •卡奥拿斯 •索菲亚列夫斯基
奥林匹亚科斯 •游击队 •史浩克零四 •布拉格斯拉维亚 •布拉格斯巴达
莫斯科斯巴达克 •标准列日 •特温特 •吉马良斯 •克拉科夫 •萨格勒布迪纳摩
第二圈外围赛出局
安德莱赫特 •耶路撒冷比达 •第比利斯迪纳摩 •当姆萨尼 •杜希达联 •流浪者 •哥德堡
MTK匈格利亚 •国际巴库 •蒙迪里卡 •维也纳迅速 •舒列夫 •谭柏利 •云特史比斯
第一圈外围赛出局
阿克托比 •朴高利卡 •地拉拿迪纳摩 •迪德朗日 •塔林利华戴亚 •连菲特 •兰利尼
梅拿达 •佩历克 •拉布历基 •云拿域克 •圣达哥林玛 •瓦莱塔 •华路亚
