2016年中国足球协会业余联赛，是中国足协所承办的业余足球联赛。本届赛事的大区赛在长春、上海、和林格尔、珠海四地全面展开，总共有来自全国各地的43支业余球队参赛。大区赛每组前四名晋级总决赛，总决赛在江苏镇江举行。总决赛优胜者：总冠军大连博阳、亚军陕西长安竞技、殿军上海申梵、第五名吉林百嘉和第六名镇江华萨等五支业余球队通过审核并晋级2017中乙联赛。
整个联赛分为三个阶段，首先是城市联赛，城市冠军参加第二阶段的大区决赛，四个大区的前四名进入全国总决赛，在以赛会淘汰赛制形式决出最后冠军。
省市级业余联赛
分区安排：
东南区：上海、深圳、宁波、杭州、青岛、安徽、镇江、无锡、南京；
西南区：珠海、肇庆、柳州、广西、昆明、四川、成都、长沙、拉萨、重庆、合肥；
西北区：内蒙古、满洲里、山西、陕西、西安、河南、武汉、甘肃；
东北区：吉林、黑龙江、河北、张家口、淄博、沈阳、天津、大连。
这只是名义上的第一阶段赛事，并没有系统的由足协组织的比赛举办。有的城市可能有多级联赛，但有的城市只是自发的赛事。最终参加大区决赛的球队更多的是地方足协邀请、指派，而非通过预选机制获得参赛名额。
东南、西南、西北、东北四个大区的大区决赛。
小组赛
东南区12队分3小组进行比赛，8队进入淘汰赛。
A组
B组
C组
8进4淘汰赛
8进4淘汰赛以一场决胜负。胜方进入全国总决赛。
小组赛
西南区12队分3小组进行比赛，8队进入淘汰赛。
A组
B组
C组
8进4淘汰赛
8进4淘汰赛以一场决胜负。胜方进入全国总决赛。
小组赛
西北区9队分两小组进行比赛，小组前两名进入全国总决赛。
A组
B组
小组赛
东北区10队分两小组进行比赛，小组前两名进入全国总决赛。
A组
B组
全国总决赛，采用小组赛加淘汰赛制。（时间：11月6-14日，地点：江苏镇江）
由以下16支大区赛晋级球队分为4组，小组赛决出前两名出线进入四分之一决赛！
A组
B组
C组
D组
小组赛出线8队进行交叉淘汰赛，胜方进入半决赛，负方进入5-8名排位赛。
胜方进入5-6名决赛，负方进入7-8名决赛。
胜方进入决赛，负方进入3-4名决赛。
