纸色谱法（又称纸色层分析法，英文：Paper chromatography）是分析化学中一种用来分离混合物的色谱技术。纸色谱法主要是用来分析染料，它已经在很大的程度上被薄层色谱法取代，但仍然是一种很好的教学工具。当初发展纸色谱法是为了分离植物的色素制成颜料，用此方法可以分离出不同颜色的色素，所以这个技术有一个英文名称chroma就是拉丁文“颜色”的意思。不过无色的混合物也可用这种方法分离，只要各成分对于溶剂及固定相有不同的亲和力就行了。双向纸上色层分析法也是纸色谱法的一种，先使用一种溶剂，进行色层分析后将试纸旋转90度，再用另一种溶剂进行色层分析，常用在类似化合物（如氨基酸）组成混合物的分析。
R值是指物质移动的距离除以溶剂移动的距离，通常用小数表示，但也有人建议用百分数代替。例如：物质移动2.1公分而溶剂移动2.8公分，那就用2.1除以2.8，得到的R值就是0.75。如果算出来的R值是0，就代表物质并没有移动；如果R是1，就代表物质和固定相没有任何吸附作用，所以物质和溶剂一起流动。
纸色谱法是一种可以测试物质的纯度与分离混合物的方法，因为它可以快速的完成分析而且对材料的限制很少，所以它是一种极方便而且有用的分析方法。纸色谱法用的分离原则跟薄层色谱法一样，物质分布在一个固定相与流动相。固定相通常是滤纸，流动相会带着物质在上面流动，这个装置将会根据混合物中不同物质对固定相的附着力和对流动相的溶解度而分离出来。分析颜料时，如果颜料中含有不只一种物质，不同颜色的物质会就根据溶剂和不同溶质的极性分开，这是因为不同的分子结构极有可能有不同的极性。这些不同的极性造就对溶剂的不同溶解度，使各种溶质会在溶剂扩散的不同位置沉淀在固定相上以斑点呈现，我们就可以根据固定相上的斑位置及大小作分析。
