储昌祚（1559年－1630年），字肩宇，南直隶宜兴人。晚明官员。
储昌祚为万历十七年（1589年）三甲进士。历任鄱阳、浦城知县，政绩卓著，离任后，在两县均入祀名宦祠。升任重庆兵备佥事，致仕归里。储昌祚为官清廉，不赞同以“清流”自居的东林党人，认为他们“非学而聚徒标榜，伐异党同”，不符合其心中士大夫的标准。
弟储显祚亦为进士，官至湖南按察使。清光绪《重刊宜兴县旧志》二人皆有传。
宜兴储氏自宋朝起即有科名。储昌祚孙储欣，中举人，为清初著名文学家。曾孙储善庆、储方庆，玄孙储在文、储大文、储郁文、储雄文，来孙储晋观、储兆丰、储元升，六世孙储宝书、储秘书皆为进士。举人亦有数人。储氏之文学渊源，在宜兴首屈一指。
