α-变形菌门

α-变形菌（Alphaproteobacteria）是变形菌门（Proteobacteria）下的一个纲。此纲的成员变异性极大，且共通点极少，但他们确实系出同源。α-变形菌大多都是革兰氏阴性菌，而有些包内寄生的物种缺少肽聚糖，而造成革兰氏染色变异。α-变形菌包含多种细菌，其中包含光自营细菌、植物共生菌（如根瘤菌）、内共生细菌（如Wolbachia），和胞内寄生细菌（如立克次体）。此外，本纲还包含已灭绝的Proto-mitochondrion（英语：Proto-mitochondrion）。真核生物的祖先摄入了此种细菌，进行内共生作用，成为后来的线粒体。还有一种生物技术上很喜欢使用的农杆菌（Rhizobium radiobacter）也是本纲成员，科学家常常使用本物种来将外来DNA导入植物基因体中。另外，一些光自营生物像是遍在远洋杆菌（Pelagibacter ubique）也属于此纲，α-变形菌的微生物可能占了海洋微生物的10%左右。关于本纲所属的目，有人反对现行的分类法，尤其是Pelagibacterales（英语：Pelagibacterales）的地位，但大体上大家还是普遍接受。细菌的分类学一直是分类学家相当头痛的问题，因为细菌的基因会彼此互相交流，且基因歧异度相当高（像是遍在远洋杆菌由于他的寄生行为，就会精简化他的基因体）。在某些目中，其成员的GC含量变异也大的夸张。举个例子，像是Pelagibacterales、立克次体目（Rickettsiales）和Holosporales三者的基因体都含有高AT含量，有人认为那其实是趋同演化所导致的假象，而反对方也有他们自己的论述。后来有人发现用以判断分类依据的rRNA中，GC含量好像好像不太会受基因体变异影响。因此，rRNA中GC含量较高的 Holosporales 就被和低GC含量的Pelagibacterales和立克次体目分开了。α-变形菌纲下有三个亚纲Magnetococcidae、立克次体亚纲（Rickettsidae）和柄杆菌亚纲（Caulobacteridae）。基群为Magnetococcidae，此类别包含了许多趋磁细菌（由于趋磁细菌为多系群，因此只有部分包含于α-变形菌之下）立克次体亚纲则由细胞内寄生的立克次体目（Rickettsiales），以及可以在胞外单独生存的Pelagibacterales。柄杆菌亚纲则由Holosporales、红螺旋菌目（Rhodospirillales）、鞘脂单胞菌目（Sphingomonadales）、红细菌目（ Rhodobacterales）、柄杆菌目（Caulobacterales）、Kiloniellales、Kordiimonadales、短小盒菌目（Parvularculales），和Sneathiellales。以下表格是根据美国国家生物技术信息中心（NCBI） 而树状图则是根据'The All-Species Living Tree' Project（英语：'The All-Species Living Tree' Project）所提供的16s rRNA分析结果?Aquaspirillum polymorphum ♠ (Williams and Rittenberg 1957) Hylemon et al. 1973?Furvibacter ♠ Lee et al. 2007?Kopriimonas byunsanensis ♠ Kwon et al. 2005?Magnetococcus marinus Bazylinski et al. 2012 (in press)?Micavibrio aeruginosavorus ♠ Lambina et al. 1983?Polymorphum gilvum ♠ Cai 2010?Reyranella massiliensis Pagnier et al. 2011?Ronia tepidophila ♠?Subaequorebacter tamlense ♠ Lee 2006?Tuberoidobacter mutans ♠?Vibrio adaptatus Muir et al. 1990?Vibrio cyclosites Muir et al. 1990Rhodovibrio红螺菌科 Rhodospirillaceae 2Tistrella红螺菌科 Rhodospirillaceae 3红螺菌科 Rhodospirillaceae 4Defluviicoccus vanus Maszenan et al. 2005Elioraea tepidiphila Albuquerque et al. 2008Acetobacteraceae立克次体目 Rickettsiales （包含线粒体）SneathiellaSphingomonadaceae （包含Erythrobacteraceae, Caulobacter leidyi, Asticcacaulis）Rhodothalassium salexigens (Drews 1982) Imhoff et al. 1998Kordiimonas红螺菌科 1根瘤菌目医学导航：病菌细菌（分类）gr+f／gr+a（t）／gr-p（c／gr-o药物（J1p、w、n、m、疫苗）