地质标本馆（日语：地質標本館／ちしつひょうほんかん）是位于日本茨城县筑波市东（日语：東 (つくば市)）一丁目的地球科学博物馆，1980年起对公众开放。
全馆共二层，入口大厅、第一展示室及第四展示室位于第一层，第二展示室及第三展示室位于第二层。馆内设有常设展示及企画展示（特别展），除展出矿物及化石标本外，亦介绍日本列岛地质构造等地球科学知识，以及地球的历史、内部构造、与人类关系方面地质调查综合中心（日语：地質調査総合センター）（原地质调查所（日语：地質調査所））的研究成果，内容较附近的“Science Square TSUKUBA”显得更为深入。许多展示物旁配有QR码，可透过智能电话等读取URL，边看说明边了解展品。
入口大厅设有地震仪，若行经附近会即时测定地面震动并显示，同时展示有循大地切片（日语：ジオスライサー）法取得的地质标本。第一展示室用光雕投影展示日本列岛立体地质图及断层、火山位置，亦可点选显示河川、物流中心、道路网等与地形有较深关联的资讯，其原型为统一各地域的地质图凡例后制成的“1:20万日本连续地质图V2”（20万分の1日本シームレス地質図V2）。第二展示室展示海洋地质及海底地形。第三展示室展示有富士山大型断面模型，并播放影片介绍岩石薄片的专业制作方法。第四展示室展出众多矿物及化石标本藏品。
入口大厅设有小型博物馆商店（日语：ミュージアムショップ），售卖地质图及原创纸胶带等。另有生产地质标本馆运营方地质调查综合中心（日语：地質調査総合センター）概念商品的品牌推出“化石朱古力”，于产综研内部FamilyMart及筑波快线筑波站售卖。
全馆免费开放，逢周一及年末年始闭馆；由于地处国立研究机构产业技术综合研究所（日语：産業技術総合研究所）内部，驾车来访者需在研究所守卫处登记。另于每月末向公众提供“地质标本馆导览游”（地質標本館ガイドツアー）服务，并依博物馆法（日语：博物館法）施行规则接受实习。地质标本馆已加入全国科学博物馆协议会及茨城县博物馆协会，现任馆长（2019年8月）森田澄人。
