药王菩萨（梵语：भैषज्यराज Bhaiṣajyarāja），后号净眼如来，与人良药，救治众生身、心两种病苦的菩萨，乃西方净土二十五大菩萨之一。药上菩萨，号净藏如来，原为药王菩萨之弟。
药王、药上两菩萨原为西方净土无量寿佛的胁侍菩萨，属于西方净土二十五大菩萨之一，但也常作为药师如来的两胁侍一并供奉，另说为“日光菩萨”、“月光菩萨”。有时两菩萨会作为释迦文佛、无嗔怒佛等佛的胁侍，以示诸佛本同一体之德。
药王菩萨的圣诞为农历四月廿八。
在过去无量无边阿僧祇劫，有琉璃光照如来，其国名悬胜幡。琉璃光照如来涅槃后，于像法中，有日藏比丘，聪明多智，为大众广说大乘，及佛祖无上清净平等大慧。当时众中有星宿光长者，闻大乘平等大慧，心中十分欢喜。用雪山良药，供养日藏比丘及众僧，并发愿以此功德，回向无上菩提。若有众生闻己名者，愿其得灭除病苦。当时长者的弟弟电光明，也随兄持醍醐良药供养日藏及诸僧众，亦发大菩提心，愿得成佛。在那时，大众赞叹星宿光长者为药王，电光明为药上，即为药王、药上二位菩萨。 此二菩萨久修梵行，诸愿已满，药王菩萨于未来世成佛，号净眼如来，药上菩萨亦成佛，号净藏如来。
一般菩萨形象：顶戴宝冠，左手握拳，置于腰部，右手屈臂，置放胸前，而以拇指、中指、无名指执持药树。三昧耶形为阿迦陀药，或为莲花。
药王菩萨身长十二由旬。随应众生或十八丈或现八尺。身紫金色三十二相八十随形好如佛无异。顶上肉髻有十四摩尼珠。其一一珠有十四楞。一一楞间有十四华。以严天冠。其天冠内有十方佛及诸菩萨。皆悉影现如众宝窴。眉间毫相白琉璃色。手十指端雨诸七宝。
另亦有把神农、岐伯、扁鹊、董杏林、华佗、孙思邈、吴夲等中国历史人物视为药王菩萨的化身，因此部分地区寺庙供奉的药王菩萨是中年男子的形象。
