侯一元,字应乾,号之川,陕西秦安县兴国镇人。明朝政治人物。
正德九年(1514年)登进士,授工部都水司主事。后改礼部主事、升兵部员外郎、兵部郎中、礼部精膳司郎中。因与同僚不合离职。此后再次起用为吏部郎中,一年后卒于任。