妹妹们（日语：
起初因量产Level 5超能力者的试验而诞生，但由于生成个体不及本体能力的百分之一而被终止；后经过树状图设计者计算后，计划重启以用于Level 6进化实验。后由于上条当麻击败一方通行使进化实验中止之后，为了因应克隆人细胞生长分裂过快而寿命不长的自身特性，妹妹们被分散到世界各地去接受对应的治疗；留在学园都市的妹妹们不到十人，并且作为人工天界的演算平台而存在。
妹妹们普通个体从00001号到20000号共有20000名，单个造价18万日币，00001号至10031号都因为一方通行的进化实验而死亡。妹妹们的武器为F2000R冲锋枪。所有妹妹的脑波彼此连线，构成“御坂网络”，并且共享一份记忆，性格上为“美琴的人格加上电波系大小姐的气质”。因为记忆共享的关系，全员对当麻都十分在意，貌似喜欢他，甚至为此内部大打出手。
妹妹们的能力是等级二至三的电击能力“缺陷电力（Radio Noise，日语：
妹妹们的外表与美琴一模一样，能力却远不如本尊（能力名称“缺陷电力”的由来），即便是两万个妹妹加起来也比不上。她们的肉眼无法观测到电磁波的存在，因此常配戴着特制的军用目视镜，平常的穿着跟美琴一样是常盘台中学的制服，加上外貌体型也一样（也有部分妹妹们特意去减肥）。所以，一旦拿下目视镜的话，尚无口头互动在先的时候，几乎就只能通过“检查裙底下是否穿四角安全裤”来分辨对方是不是美琴本尊。
根据小说中的描述，妹妹们会把目光均匀发散到自己能够看到的每个物体上，这就是为什幺妹妹们的瞳孔看起来与美琴有些许的差别。此差别在《魔法禁书目录》动画第一、二部中是以放大的瞳孔具体化，但在《某科学的超电磁炮》动画第二、三部中则为瞳孔有咖啡色反光，而在《科学一方通行》动画则与《魔法禁书目录》类似但瞳色为灰蓝色。
由于现在实验已经终止了，所有妹妹们也开始过安稳和平的生活，但因入世未深而对很多事缺乏常识。
17000号是驻扎于英国加拉希尔斯的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
18022号是驻扎于瑞士洛桑的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
14333号是驻扎于墨西哥的瓜达拉哈拉的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
15110号是驻扎于阿根廷德赛阿多的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
12053号是驻扎于印度艾哈迈德纳格尔的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
11899号是驻扎于委内瑞拉的拉·巴拉瓜尔的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
16836号是驻扎于加拿大穆索尼的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
19900号是驻扎于南极的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
12083号是驻扎于泰国清迈的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
10855号是驻扎于波兰什切青的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
17203号是驻扎于意大利法恩莎的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
19488号是驻扎于西班牙洛格罗诺的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
15327号是驻扎于韩国群山的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
13072号是驻扎于法国安格雷姆的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
17403号是驻扎于巴西库达加斯的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
12481号是驻扎于斯洛文尼亚采列的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
18072号是驻扎于挪威伯根的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
19348号是驻扎于芬兰罗凡尼米的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
17009号是驻扎于澳大利亚悉尼的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
15113号是驻扎于葡萄牙布拉干萨的妹妹，在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务。
14014号在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务，并疑问为何10032号会发出紧急报告。
18829号在小说第SS2集中，参于了拯救原石及收集原石到学园都市的任务，并提问10032号为何发出紧急报告及要求说明。
00000号（日语：00000号／フルチューニング，Full Tuning）是除了最后之作外，由天井亚雄所培育的特别个体，编号00000（可能是最初培育的第一个克隆人），由于这名个体并未与御坂网络连结，所以目前所在地与现况不明。由于编号相仿，最初有爱好者推测0号和00000号是同一个人，但《魔法禁书目录》编辑荻野谦太郎在一个问答项目中声明了两者并非同一个人。
