第三航空舰队（日语：第三航空艦隊／だいさんこうくうかんたい ?）是旧日本海军在太平洋战争末期组建的一支陆基海军航空兵编制。此时盟军反攻的前锋已经抵达菲律宾和荷属东印度一带，三航舰主要负责日本本土南部及南方诸岛屿的空中防卫任务，同时试图在马里亚纳群岛牵制盟军的进攻步伐。
1944年7月5日，海军提议将负责小笠原方面作战的第27航空战队（八幡空袭部队）以及横须贺海军航空队（日语：横須賀海軍航空隊）之一部，编成为第三航空舰队。八幡空袭部队的任务，是在负责本州南部及南方诸岛的航空作战的同时，寻机对马里亚纳群岛方面之敌发动奇袭。10日，三航舰正式成立。三航舰的编制采取了所谓“空地分离方式（日语：空地分離方式）”，航空部队归舰队司令长官直属，而地面支援队伍归航空战队管辖。编成当天，联合舰队司令长官丰田副武海军大将作出指示，以三航舰配置在本州东部及南方诸岛，负责该方向作战，同时与第五基地航空部队紧密配合，策应对马里亚纳方向的奇袭。
