Peak calling

✍ dations ◷ 2025-09-08 22:18:14 #分子生物学,DNA测序,生物信息学

Peak calling是一种用于鉴定经染色质免疫沉淀-测序或MeDIP-测序实验后所得到的比对读段富集在基因组哪些区域中的一种计算方法。当免疫沉淀的蛋白质是一种转录因子时,那么DNA的富集区域就是这种它的转录因子结合位点(TFBS)。主流的Peak calling软件有MACS等。

Peak calling可应用于转录组/外显组测序,亦可用于对MeRIP-测序或m6A-测序的RNA表观基因组测序数据进行分析;利用如exomePeak等的软件程序,可检测出转录后RNA修饰位点。

相关

  • 氧化锌氧化锌是锌的氧化物,难溶于水,可溶于酸和强碱。它是白色固体,故又称锌白。它能通过燃烧锌或焙烧闪锌矿(硫化锌)取得。在自然中,氧化锌是矿物红锌矿的主要成分。人造氧化锌有两种制
  • 联邦警卫局联邦警卫局(俄语:Федеральная служба охраны,俄语缩写:ФСО,拉丁语转写缩写:FSO)是俄罗斯联邦负责保护总统和其他高级别官员的机构,它继承自苏联时代的克
  • 维格列汀维格列汀(英语:Vildagliptin),商品名为高糖优适,是一种二肽基肽酶-4抑制剂类口服抗糖尿病药,用来治疗第2型糖尿病。维格列汀是唯一一种无论在高血糖或低血糖时都可以抑制胰高血糖
  • 法国及印第安人战争英法北美战争(英语:French and Indian War),或加拿大所称的征服战争(英语:War of the Conquest),是1754年至1763年间大不列颠王国和法兰西王国在北美的一场战争。1756年,战争扩大至世
  • 斯特灵斯特灵(英语:Stirling)是英国苏格兰地区的32个一级行政区之一,地处苏格兰中部。面积2,187km²,人口86,212。苏格兰主要河流之一的福斯河发源于境内并东向爱丁堡入海。行政区北部
  • 荔枝公园荔枝公园是地处中国广东省深圳市福田区的一所市政公园,总面积为28公顷。于1982年在原地原有589株荔枝和低洼稻田基础上改建成园,主要景点为荔香阁、荔湖、揽月桥等。荔枝公园
  • 叙利亚及黎巴嫩澳大利亚 英国维希法国叙利亚-黎巴嫩战场(也被称为出口商行动)是第二次世界大战中,盟军为了攻占维希法国控制的叙利亚与黎巴嫩的一场战役,时间为1941年6月至7月。当这场战役正
  • 风筒吹风机是一种可将头发吹干的电器,在19世纪末发明。现代吹风机以电动方式加速空气流动速度,故产生风,并同时提高空气温度的机械装置。大部分的吹风机都会经过发热线吹出热风,加速
  • 黄武黄武(222年十月-229年四月)是三国时期东吴的君主孙权的第一个年号,共计8年。这也是东吴政权的第一个年号,在221年时孙权以诸侯名义上是向曹魏称藩属,但随着222年魏吴之间的关系持
  • 约翰·查尔斯·波拉尼约翰·查尔斯·波拉尼(英语:John Charles Polanyi,1929年1月23日-),出生于柏林,匈牙利犹太裔加拿大化学家。加拿大多伦多大学化学系教授。波拉尼曾于1982年获沃尔夫化学奖。1986年,