Peak calling

✍ dations ◷ 2025-02-23 20:30:46 #分子生物学,DNA测序,生物信息学

Peak calling是一种用于鉴定经染色质免疫沉淀-测序或MeDIP-测序实验后所得到的比对读段富集在基因组哪些区域中的一种计算方法。当免疫沉淀的蛋白质是一种转录因子时,那么DNA的富集区域就是这种它的转录因子结合位点(TFBS)。主流的Peak calling软件有MACS等。

Peak calling可应用于转录组/外显组测序,亦可用于对MeRIP-测序或m6A-测序的RNA表观基因组测序数据进行分析;利用如exomePeak等的软件程序,可检测出转录后RNA修饰位点。

相关

  • 真核域真核生物(学名:Eukaryota)是其细胞具有细胞核的单细胞生物和多细胞生物的总称,它包括所有动物、植物、真菌和其他具有由膜包裹着的复杂亚细胞结构的生物,而不包括细菌和古菌,因它
  • 陶片放逐制陶片放逐制(希腊文:ὄστρακον;英文:Ostracism),又译陶片流放制、陶片放逐法、陶片流放法或贝壳流放法等,是古代雅典城邦的一项政治制度,由雅典政治家克里斯提尼于前510年创立
  • 扁桃酸扁桃酸(化学式:C8H8O3),又名苦杏仁酸、苯乙醇酸,学名α-羟基苯乙酸。白色斜方片状结晶,露置遇光变色分解。易溶于乙醚和异丙醇,溶于水和乙醇。扁桃酸及其衍生物在体内是肾上腺素和
  • 拉瓦节安托万-洛朗·德·拉瓦锡(法语:Antoine-Laurent de Lavoisier,1743年8月26日-1794年5月8日),法国贵族,著名化学家、生物学家,被后世尊称为“近代化学之父”。他使化学从定性转为定量
  • Geneva日内瓦(法语:Genève,发音:;阿皮坦语:Genèva; 德语:Genf,发音 ;英语:Geneva,发音:)是瑞士第二大城市,日内瓦州首府。建在日内瓦湖流入罗讷河之处。今天,日内瓦在国际上享有的高知名度主要得
  • 昌图昌图县位于中国辽宁省东北部,是辽宁省省管县制度单位(市级县,厅级县)。原辖属铁岭市,辽宁省第二个省管县单位。昌图县为辽宁肉类生产第一大、中国第八大县市,面积4321.7平方千米,县
  • 丁香树约20种丁香属(学名:Syringa),又称紫丁香属,该属多种植物的统称为丁香,别名“百结”、“情客”、“紫丁香”,生长于温带及寒带,落叶灌木或小乔木,圆球形树冠。单叶对生,卵圆形,圆锥花序,
  • 李昑朝鲜英祖(朝鲜语:조선 영조/朝鮮英祖 Joseon Yeongjo;1694年10月31日-1776年4月22日),名李昑(朝鲜语:이금/李昑 Yi Geum),幼名禧寿,字光叔,号养性轩。是朝鲜王朝的第21代君主,在位时期为1
  • 英德海军协定英德海军协定是英国和纳粹德国于1935年6月18日就两国海军军备力量所签订的条约。条约主要规定:德国海军舰艇总吨位不超过华盛顿海军条约和伦敦海军条约所规定的英联邦国家海
  • JHU Press约翰斯·霍普金斯大学出版社(英语:Johns Hopkins University Press,也由以约翰霍普金斯大学出版社或JHUP的简称)是约翰斯·霍普金斯大学的出版部门。它始建于1878年,拥有在美国连