Peak calling

✍ dations ◷ 2025-08-10 16:07:06 #分子生物学,DNA测序,生物信息学

Peak calling是一种用于鉴定经染色质免疫沉淀-测序或MeDIP-测序实验后所得到的比对读段富集在基因组哪些区域中的一种计算方法。当免疫沉淀的蛋白质是一种转录因子时,那么DNA的富集区域就是这种它的转录因子结合位点(TFBS)。主流的Peak calling软件有MACS等。

Peak calling可应用于转录组/外显组测序,亦可用于对MeRIP-测序或m6A-测序的RNA表观基因组测序数据进行分析;利用如exomePeak等的软件程序,可检测出转录后RNA修饰位点。

相关

  • 茶渍纲茶渍纲(学名:Lecanoromycetes)是子囊菌门盘菌亚门的一个纲,包含约九成的已知地衣真菌,其下共有14个目,种类达上万种,是真菌界中物种数最多的纲之一。本纲中的地衣在陆域生态系中扮
  • 阿达帕林阿达帕林(Adapalene)是第三代维A酸类药物,主要用于治疗轻中度痤疮,也被用来治疗毛囊角化症(非适应症型用药)和其他皮肤症状。阿达帕林1995年由法国高德美公司研制,商品名为达芙文。
  • 滨海省滨海省(英语:Littoral Province、法语:Province du Littoral)是喀麦隆的一个省,位于西部几内亚湾岸。萨纳加河在本省流入海。面积65,576平方公里,2004年人口2,202,340人。首府杜阿
  • 槟榔属槟榔属(学名:Areca)是棕榈科下的一个属,为乔木植物。该属共有约54种,分布于亚洲热带和澳大利亚北部。
  • Fel d 1Fel d 1(Felis domesticus allergen 1)是猫的一种蛋白质,由CH2基因编码。Fel d 1主要在猫的唾液腺和皮脂腺中分泌,是存在于猫身上的主要过敏原。目前尚未清楚这种蛋白质在动物体
  • 暖通空调暖通空调(heating, ventilation and air conditioning,简称HVAC)是指室内或车内负责暖气、通风及空气调节的系统或相关设备。暖通空调系统的设计应用到热力学、流体力学及流体
  • 林森南路林森南路,是台湾台北市南北向主要道路之一,原为上海路及沈阳路,位于台北市的中正区。林森南路属双向道路,每向二至三线道,不分段,北接林森北路,南接南海路,并以地下道穿越中正纪念堂
  • P血型系统P血型系统(英文:P Antigen System)是人类血型系统的一种,其基因座位于22号染色体上。其抗原以糖脂形式存在,包括P1、P2、Pk1、Pk2以及p五种表型。1927年,奥地利生物学家卡尔·兰德
  • 空气湿度湿度(英语:Humidity)一般在气象学中指的是空气湿度,它是空气中水蒸气的含量。与蒸汽干燥度(也称蒸汽的品质,英语:dryness fraction of steam, quality of steam)不同,空气中液态或固
  • 闭央不圆唇元音闭央不圆唇元音是母音的一种,使用于许多口语语言之中,其国际音标的符号为 ⟨ɨ⟩,另一种符号为 ⟨ï⟩,相对应的X-SAMPA符号则为 ⟨1⟩。表内成对的元音分别为不圆唇/圆唇。