纪元宪（1564年－1639年），字荩莪，南直隶池州府贵池县人，明朝军事人物。
纪元宪是万历三十一年（1603年）的武举人，次年（1604年）联捷武进士，获授汀漳守备，历任中营游击、广东东山营参将、福建南路副总兵、广东总兵都督佥事；四十七年（1619年）时征蛮将军空缺，内阁阁臣召来兵科官员询问剿灭袁八老之总兵官，得知是纪元宪后，阁臣回答：“袁八老肆虐多年无法剿灭，他能一鼓擒下，这功劳怎能不录？”因此在天启元年（1621年）以晋官南京后军都督府佥书兼神机营提督福建、广东，不久为挂印镇守广西总兵。闽广两地沿海，经常有海盗侵犯，人民总是受害，而前任镇守武官大多胆小软弱，贼人来临望风而逃；贼人劫掠后则冒功领赏，他初任守备时驾驭部下严明，对战身先士卒，剿抚不持成见，故任官数十年都在两地。
当初元宪尚未习武，某天遇上异士对他说：“你铁面冰牙，他日掌握兵权，但七九年后就应该急流勇退！”到崇祯二年（1629年）他六十六岁，想起这番说话，遂上奏辞官回乡，获赐银建坊，封祖上三代如其官，至崇祯十二年（1639年）去世。当中两位儿子纪一任、纪一让都是诸生，另两位儿子中，纪元奇中山东武举以征白莲教功升任守备，纪元照则中三科武举，官至后军都督同知。
