自身免疫性疾病（Autoimmune disease，缩写为AID），亦作自身免疫问题，指人体内异常的免疫反应攻击了正常细胞。目前至少有80种自身免疫性疾病。身体任何部位都可能发生。常见症状包括轻度发热，感觉疲倦。
所谓异常的免疫能力，就是认友为敌，把自己身体里本来不是病毒或细菌的东西，当成病毒或细菌来攻击，希望将之驱出体外。人体内免疫系统的抗体原本是针对外来的抗原或体内不正常的细胞（如肿瘤细胞）进行攻击与清除，是保护身体的一种生理机制。但在一些情形下，免疫系统可能会产出对抗自己身体内正常细胞（甚至细胞内的各种正常组成部分）的抗体，造成不正常的过度发炎反应或是组织伤害，进而影响身体健康造成疾病。这些认友为敌、攻击不该攻击对象的抗体，便称为自身免疫抗体（Autoantibody，亦作自身抗体）。
目前发生原因仍不明确。某些自体性免疫疾病如家族性红斑性狼疮以及某些案例中是由感染或其他环境因子诱发。一般认为是自身免疫造成的常见疾病包括乳糜泻、1型糖尿病、格雷夫斯病、炎症性肠病、多发性硬化症、牛皮癣、类风湿性关节炎和全身性红斑狼疮。诊断上难以鉴定。
治疗方式取决于病情的类型和严重程度，常使用非甾体抗炎药（NSAIDs）和免疫抑制剂，也可使用静脉免疫球蛋白。治疗能改善症状，但通常不能根治这些疾病。
美国约有2,400万（7%）人受到自身免疫性疾病的影响。女性发生比例较男性高。通常在成年期间开始发生。自身免疫性疾病在20世纪初第一次被描述。
目前还不能完全确定这些自身免疫抗体的成因是什么。自身抗体所攻击的，大都是细胞核，或是细胞里的其他目标。随它们攻击目标的不同，有攻击“染色体”的，有攻击“(双链)DNA”的，有攻击“RNA”的，还有攻击“ENA（Extractable nuclear antigen）”的,等等许多种。由于不论“染色体”还是“(双链)DNA”还是“RNA”，还是“ENA”，都是构成细胞与我们身体必要的元素，所以免疫系统一旦将之视为仇敌，不断地攻击，就会造成我们的细胞与器官遭到破坏的严重后果。
事实上，由于自身抗体攻击的对象极为细微、复杂，所以自身抗体的种类也极为繁多。以攻击“ENA”的抗体，也就是所谓的“抗ENA抗体”(Anti-ENA Antibodies)而言，就可再细分为“抗Sm抗体”、“抗SS-A/Ro抗体”、“抗SS-B/ La抗体”、“抗Scl-70抗体”、“抗RNP抗体”等多种。
一种抗体，可能形成多种不同的病症。譬如说，“抗SS-A/Ro抗体”可能导致“干燥性综合征”，或者“红斑性狼疮”等等。
一种病症，也可能是由各种不同的抗体所导致。譬如说，“红斑性狼疮”可能是“抗SS-A/Ro抗体”所导致，但也可能是“抗Sm抗体”、“抗SS-B/ La抗体”等等所导致。
表位（线性、构象）
抗体（单株抗体、多株抗体、自身抗体） · 多株 B 细胞反应 · 同种异型 · 同种型 · 遗传型
