南牟娄郡（日语：南牟婁郡／みなみむろぐん */?）为位于日本三重县南部的郡。
现辖有以下2町：
在1879年实施郡区町村编制法（日语：郡区町村編制法）时的辖区还包括现在的熊野市全部地区及尾鹫市的南半部地区。
在实施令制国之前属于熊野国，令制国时代后才全数属于纪伊国，并划入牟娄郡。
江户时代后成为纪州藩纪州德川家及其御付家老（日语：御付家老）水野氏（日语：水野氏）纪伊新宫藩（日语：紀伊新宮藩）的领地；19世纪末明治维新实施废藩置县后这些区域改隶属和歌山县和新宫县，1872年的第一次府县整并后，将原属牟娄郡位于熊野川已被的区域划入度会县，1876年第二次府县整并后再被并入三重县。
1879年实施郡区町村编制法（日语：郡区町村編制法）时，正式从牟娄郡分出设置近代的行政区划“南牟娄郡”，并在木本浦（位于现在的熊野市）设置郡役所。
