阿塞拜疆－吉布提关系是阿塞拜疆与吉布提之间的双边关系。阿塞拜疆与吉布提两国均无派遣常驻大使至对方国家。阿塞拜疆与吉布提两国同为不结盟运动成员。
阿塞拜疆与吉布提两国之间在1996年10月22日建立外交关系。2016年后，两国之间的关系进一步加强。吉布提共和国完全尊重阿塞拜疆共和国的主权和国际公认的领土完整。2017年，吉布提国民议会议长率国会代表团赴阿塞拜疆出席跨文化对话国际论坛。
2017年5月3日，时任阿塞拜疆国民议会议长（英语：Speaker of the National Assembly of Azerbaijan）鄂泰·阿沙杜夫（英语：Ogtay Asadov）接见时任吉布提国民议会议长穆罕默德·阿里·侯迈德（محمد علي حمد）一行人。
2017年1月，吉布提国民议会通过了一项决议，承认霍贾利大屠杀为种族灭绝行为和危害人类的罪行。该决议亦涉及亚美尼亚对阿塞拜疆领土的侵占。
2017年4月10日，根据阿塞拜疆共和国总统伊利哈姆·阿利耶夫的命令，阿塞拜疆紧急情况部（英语：Ministry of Emergency Situations (Azerbaijan)）派遣一架载有人道主义援助的飞机从巴库飞抵吉布提市。相关人道主义援助包括饮用水、糖、茶、葵花籽油、粟米油、面粉、通心粉、粉丝等。
在2016年11月30日阿塞拜疆航空总裁访问吉布提期间，阿塞拜疆航空公司与吉布提红海航空（英语：Air Djibouti）公司签署扩大合作范围的谅解备忘录。此外，两方亦达成开通巴库－吉布提货运航班与成立阿塞拜疆－吉布提联合货运公司的协议。
