巴塔哥尼亚荒漠（西班牙语：Patagonia extraandina），也被称为巴塔哥尼亚草原，是阿根廷最大的荒漠，亦为世界第七大荒漠，占地673000平方公里。其沙漠主要位于阿根廷，智利南部，西侧以安地斯山脉为界，东侧以接邻大西洋，南部有许多如峡湾的冰河地形。
巴塔哥尼亚大部分地区为荒漠，因受福克兰寒流的影响，气候寒冷干燥，愈往沙漠南部，气候雨量呈带状降低，年雨量平均介于90-450毫米之间，年均温在摄氏6-20度。但因当地雨量不多，加上大部分的河流属于间歇河，于是沙漠中央的主要植披为草原，而沙漠的西部降水量较高，灌木就取代草本为主要植物。
目前居住在此的人，有19世纪西班牙殖民时期迁移到此以狩猎采集维生的马普切人，并以饲养羊和马作为主要经济来源。
巴塔哥尼亚荒漠，位于阿根廷南部，北起南纬36°的科罗拉多河，南至麦哲伦海峡、火地岛，西缘安地斯山，东临大西洋。面积约为673000平方公里，占阿国领土的28％，扩及阿国四省和火地岛。
巴塔哥尼亚地处温带，但由于位居安地斯山脉的背西风坡上，而造成雨影效应，受焚风效应影响，造成降水稀少，再加上福克兰寒流造成周围气压偏高，气候寒冷干燥，愈往南部愈寒冷且雨量愈少，因而大多地区形成荒漠。
