日本性文化是指在日本国形成的关于性的文化。
日本文化强烈受到中华文化的影响。中华文化对在宋代理学家朱熹提出“存天理灭人欲”之前对性不排斥，早期《圣经》认为性和罪同时存在，日本性文化却没有这些束缚。
根据《古事记》记载，日本创世神话认为日本列岛和其岛上的人都是天神交合的产物。一般有两个版本的传说。其一：天神伊邪那岐命和伊邪那美命是兄妹俩，兄妹俩树立天之玉柱，建立起八寻殿。一天，哥哥问妹妹，“你的身体长成了吗？”，妹妹回答：“我的身体已经完全长成，只有一处没法合在一起。”哥哥随后说：“我的身体已经完全长成，只有一处多余。我把我的多余处塞进你的没合处，生成国土，怎么样？”妹妹答应了，于是两人结合生成了日本列岛。其二：天照大神和他的妹妹用神矛和神盾搅动东海产生日本列岛，两人在日本列岛繁衍了大和民族。大和民族从不避讳自己是天神乱伦或者先祖乱伦的后裔，体现了早期大和民族对于性文化的崇拜和宽容。
中古时期，大和族对生殖器的崇拜制成了各种艺术品，伫立在大街上或者作为保护神。在早期日本，结婚前，女子不会刻意保护贞操，而贞操和名誉也没有任何直接性的关系。与此同时，男子也不重视妻子是否是处女。《源氏物语》是日本一部作品，也是世界最早的长篇小说。
然而，进入镰仓时代，幕府令武家严守上下尊卑的文化开始于上层社会普及，而这时代父系制及父权制已成为主流，有男尊女卑观念，于是上层社会开始重视女性的贞操，到了江户时代受到理学影响，再加强对女性贞操的要求，不但要求女性婚后守贞操，夫死后不改嫁，还要求女性婚前为处女。据江户幕府制定《御定书百个条》，武士可以将秘密通奸的妻子及其奸夫处死。男性的性则没有限制，于是各种专接待贵族男子的高级妓院盛行，更把寻花问柳视为身份象征。同时贵族阶层也盛行男性的同性性行为，更发展成一种上层社会当中上下阶级关系相关的制度众道。而町人及庶民男女则仍然保持比较为开放的性观念。当时文学家井原西鹤创作了《好色一代男》《好色一代女》等反映各阶层性文化的文学名著。
近代日本性文化的发展出现不同的路线，受到理学贞操观及西方基督教的传入，明治维新后女子比前代更重视贞操，男子的性观念则无明显的改变。军部认为性需求的满足可以提高军队战斗力，故而在第二次世界大战时期有日本皇军的地方就有慰安所和慰安妇，也即军立妓院与领薪军妓。早期为日本国内自愿的日本女人，后期由于人员不够，就在被占领国征召慰安妇。
日本无条件投降后，随着世界各地对性的观念日渐开放，日本性产业也盛行起来。日本的成人视频业极为发达，是国民经济支柱产业之一。电影、电视、书籍和漫画无处不在，并且形成了AV女优明星。吉泽明步、松岛枫、饭岛爱、苍井空和小泽玛利亚等闻名世界。日本的成人用品店也是鳞次栉比，从性爱用具到性爱装束，从性爱食品到性爱影碟，各种性文化产品俱全。现代性观念和性文化的开放也给日本带来负面影响，造成了令政府头疼的问题，例如援助交际等等。
日本除了没有中国的缠足文化外，也没有宦官文化。大正时期著名历史学者桑原隲藏有一篇《中国的宦官（日语：支那の宦官）》写道：“独我国自隋唐以来广泛采用中国的制度文物，但惟有宦官制度不拿来，这不能不说实在是好事。英国的斯坦特曾发表论文《中国的宦官》，一语道破：东洋各国如此普通的宦官制度在西洋却不太流行，这完全托基督教的福。然而，我国丝毫不指望宗教的力量，竟然不沾染此一蛮风，岂不更足以自负。我们就此也必须十分感谢我国当时先觉者的思考辨别。”人类学家石田英一郎则指出：“去势本来是一种畜牧技术，被文明国家应用到宫廷生活中来。从文化史或文化圈来看，大陆文化要素未传入日本或者日本未普及的，大部分直接或间接地属于畜牧性文化系统。”然而最早发明人体阉割技术与宦官系统的地区是古埃及，而非游牧民为主的地区。宦官文化更多发源于东方专制主义（Oriental Despotism），封建制（Feudalism）盛行的地区如西欧和日本便少有宦官，乃是社会结构使然。
性文化代表人物：紫式部、井原西鹤、渡边淳一。浮世绘画家铃木春信。
