CPK配色

✍ dations ◷ 2025-11-27 17:30:22 #分子建模,色彩

在化学中,CPK配色是一种国际通用的原子或分子模型的配色方式,也是最常用、最多人使用的分子模型上色方式,可用于各种分子模型或元素标示,最常用于CPK模型、球棒模型和空间填充模型。该配色方式由CPK模型的设计者Corey、Pauling(莱纳斯·鲍林)与Koltun提出且改进。

1952年,科里和鲍林发表了描述蛋白质和其他生物分子的空间填充模型,他们已经在加州理工学院制做出一个模型。他们用硬木球表示原子并涂上一些代表性的鲜艳颜色,来表示相应的化学元素。他们的上色模式为:

他们还建立塑料球小模型使用搭配同色系的架构。

1965年,Koltun将Corey和鲍林建模技术的改进版本申请专利获准。在他的专利中,他提到了以下颜色:

现在常用的CPK配色将色彩更变为:

典型的CPK配色包括:

有些CPK颜色是来自于纯元素的颜色或该元素的常见化合物的颜色,以便于记忆。例如,氢是一种无色气体;碳、木炭或石墨皆是黑色;常见的硫是黄色的;氯气是一种绿色气体;溴溶于乙醚是一个暗红色的液体;碘是紫罗兰色的;无定形磷是红色;铁锈是暗橙色红色等。对于一些的颜色,如氧气和氮气,则来源不可考。也许是因为氧气燃烧或含氧血液中血红蛋白呈红色所以将氧定义成红色;氮是地球的大气层的主要组成部分,从而出现到人眼看到的天空为天蓝色因此将氮设定成蓝色。

一般化学键的颜色会依据邻近元素上色,若两端元素相同,则将键漆上邻近原子的颜色,若两端原子不同,则依照电子云可能的分布来决定两端元素在键上上色的比例。有些模型则将键统一涂上同一种颜色,常见的颜色为灰色或白色。离子键一般不会描绘,另外氢键也有人使用黄色的虚线表示

下表显示了一些流行的软件分配给每个元素的颜色。C列是原始由Corey和鲍林设定的CPK配色,K是Koltun的专利,J列是由分子可视化的Jmol使用的配色方案,R列是Rasmol使用的配色方案,其显示两种颜色,第二种表是2.7.3及以后版本所使用的颜色。所有的颜色都很相似的,并且可能依赖于显示硬件和观看条件。

相关

  • 蚱蜢总科:蚤蝼总科Tridactyloidea总科:区蚱总科Tetrigoidea总科:蜢总科Eumastacoidea总科:牛蝗总科Pneumoroidea总科:锥头蝗总科Pyrgomorphoidea总科:蝗总科Acridoidea总科:长角
  • 西洛他唑西洛他唑(Cilostazol)为一种喹啉衍生类药物,可用于缓解周边动脉阻塞患者的间歇性跛行(英语:intermittent claudication)的症状。本品的制造商为大冢制药,以商品名普达锭(Pletaal)贩售
  • 国家民主与权利共同体国家民主与权利共同体(俄语:Сообщество за демократию и права народов),通常也被称为未被普遍承认国家联合体, 又被称为CIS-2(小独联体)(Со
  • 玛家坐标:22°42′31″N 120°38′58″E / 22.7086763°N 120.6494041°E / 22.7086763; 120.6494041玛家乡(排湾语:Makazayazaya)位于台湾屏东县东北方,北临三地门乡,东侧和北侧连雾
  • 阿米巴痢疾阿米巴痢疾是痢疾的一种,因溶组织内阿米巴变形虫的原虫感染结肠引起。阿米巴痢疾主要是通过粪便污染所传染。多见于热带地区卫生较差的农村,夏秋季发病率较多,其中以成年男性患
  • 雄性化雄性化(英语:Virilization、masculinization)是两性异形发展时的生理发育过程,这个阶段产生的变化会使得雄性的身体变得与雌性不同。大部分雄性化都是由雄激素引起。“雄性化”
  • 太阳系天体发现时间列表这是数百年来太阳系内所发现的卫星的时间列表。为了比较,天王星、海王星、冥王星的发现时间都包括在内。最初的六个小行星也都被包括在内,之后,每年都有新的小行星发现,而开始的
  • 鼷鹿科鼷鹿科(学名:Tragulidae),是一类小型的哺乳纲偶蹄目动物,它们是反刍亚目下最原始的成员。鼷鹿属主要分布于东南亚地区,水鼷鹿属分布在非洲的热带森林中。鼷鹿类仅有3胃室,反刍能力
  • 西南西南英格兰(英语:South West England)是大不列颠及北爱尔兰联合王国英格兰下辖的9个次级行政区之一,也是英国国内最为风景优美且历史悠久的地区之一。西南区境内包含Dartmoor和E
  • 三氧化二锫三氧化二锫是锫已知的两种氧化物之一,化学式为Bk2O3。它可由二氧化锫在600°C的氢气流中加热还原得到。它是浅棕黄色的固体,属于立方晶系,晶胞参数a=10.880±0.005。它在氯化氢