CPK配色

✍ dations ◷ 2025-04-02 17:02:17 #分子建模,色彩

在化学中,CPK配色是一种国际通用的原子或分子模型的配色方式,也是最常用、最多人使用的分子模型上色方式,可用于各种分子模型或元素标示,最常用于CPK模型、球棒模型和空间填充模型。该配色方式由CPK模型的设计者Corey、Pauling(莱纳斯·鲍林)与Koltun提出且改进。

1952年,科里和鲍林发表了描述蛋白质和其他生物分子的空间填充模型,他们已经在加州理工学院制做出一个模型。他们用硬木球表示原子并涂上一些代表性的鲜艳颜色,来表示相应的化学元素。他们的上色模式为:

他们还建立塑料球小模型使用搭配同色系的架构。

1965年,Koltun将Corey和鲍林建模技术的改进版本申请专利获准。在他的专利中,他提到了以下颜色:

现在常用的CPK配色将色彩更变为:

典型的CPK配色包括:

有些CPK颜色是来自于纯元素的颜色或该元素的常见化合物的颜色,以便于记忆。例如,氢是一种无色气体;碳、木炭或石墨皆是黑色;常见的硫是黄色的;氯气是一种绿色气体;溴溶于乙醚是一个暗红色的液体;碘是紫罗兰色的;无定形磷是红色;铁锈是暗橙色红色等。对于一些的颜色,如氧气和氮气,则来源不可考。也许是因为氧气燃烧或含氧血液中血红蛋白呈红色所以将氧定义成红色;氮是地球的大气层的主要组成部分,从而出现到人眼看到的天空为天蓝色因此将氮设定成蓝色。

一般化学键的颜色会依据邻近元素上色,若两端元素相同,则将键漆上邻近原子的颜色,若两端原子不同,则依照电子云可能的分布来决定两端元素在键上上色的比例。有些模型则将键统一涂上同一种颜色,常见的颜色为灰色或白色。离子键一般不会描绘,另外氢键也有人使用黄色的虚线表示

下表显示了一些流行的软件分配给每个元素的颜色。C列是原始由Corey和鲍林设定的CPK配色,K是Koltun的专利,J列是由分子可视化的Jmol使用的配色方案,R列是Rasmol使用的配色方案,其显示两种颜色,第二种表是2.7.3及以后版本所使用的颜色。所有的颜色都很相似的,并且可能依赖于显示硬件和观看条件。

相关

  • Dy4f10 6s22, 8, 18, 28, 8, 2蒸气压3, 2, 1 (弱第一:573.0 kJ·mol−1 第二:1130 kJ·mol−1 第三:2200 kJ·mol主条目:镝的同位素.mw-parser-output ruby>rt,.mw-parser-out
  • 建瑞县建瑞县(越南语:Huyện Kiến Thụy/.mw-parser-output .han-nom{font-family:"Nom Na Tong","Han-Nom Gothic","Han-Nom Ming","HAN NOM A","HAN NOM B","Ming-Lt-HKSCS-UNI-H"
  • AP-1在分子生物学中,AP-1转录因子(激活蛋白1,英语:activator protein 1,AP-1)是一种异二聚体蛋白转录因子,由c-Fos、c-Jun、JDP以及ATF家族的不同蛋白组成,调节基因表达以响应多种外界信
  • 蔬果蔬果泛指蔬菜和水果,亦可以是两者的统称,是人类日常生活的必须食品。医学界建议每天至少要进食5份蔬果,即2份水果、3份蔬菜,但不要饮果汁。最好每天进食7份蔬果。蔬菜和水果都属
  • 信息与计算科学信息与计算科学专业(Information and Computing Science)是中国大陆的一个数学统计类专业名,隶属于计算科学范畴。1987年计算数学专业更名为“计算数学及其应用软件”,1998年中
  • 一中两国一个中国,两个中国人国家(英语:One china, two states),简称一中两国。1998年2月22日,新党的“十人小组”连署提出海峡两岸关系政治性论述,但被当时众多统派人士反对,这段历史也被称
  • 雀类雀科(学名:Passeridae)又名麻雀科,为鸟纲雀形目的一个科。本科有8属43种。
  • 蔡家话蔡家话,是一种主要分布在贵州西部的一种独特语言,是未识别民族蔡家人的本族语言,目前濒临灭绝。有30个声母,塞音,塞擦音有全清次清全浊的对立,没有复辅音。有单元音10个,另有若干后
  • 国家进出口商品检验局国家进出口商品检验局(简称国家商检局)是中华人民共和国国务院曾经设立的一个国家局。1949年11月,中央人民政府贸易部国外贸易司商检处成立,负责进出口货物的检验工作。根据中央
  • 九龙山 (北京)九龙山位于北京朝阳区,广渠路与西大望路交叉点。九龙山地铁站是北京地铁7号线和 █ 14号线的换乘站。途径北京九龙山公交站的有11路、30路、382路等14条公交线路。北京九龙山