曹申吉(1635年-1680年),字锡馀,别号澹馀,清初大臣,山东安丘县城东关人。
祖父曹铨,官光禄寺丞;父曹复植为弟子员,早亡;兄曹贞吉。申吉八岁能文,十七岁中举人。顺治十二年(1655年)中进士,选内翰林院庶吉士,顺治十四年授国史院编修。顺治十五年补湖广下荆南道参议。顺治十六年调任河南睢陈兵备副使。康熙九年调任吏部右侍郎后,康熙十年官至贵州巡抚,三藩之乱时投降吴三桂,康熙十九年,“蜡书赴阙,密陈机宜”,事泄被执,在昆明双塔寺旁古井被害。康熙二十二年灵柩由云南运回故里。康熙帝以其降吴,定为“逆臣”,雍正帝撤销其罪名。工诗,有《澹余诗选》。曾修《贵州通志》。