尤金·摩尔·休梅克（英语：Eugene Merle Shoemaker，或别名吉恩·休梅克，英语：Gene Shoemaker，1928年4月28日－1997年7月18日），出生在洛杉矶，美国天文学家，行星科学领域的奠基者。他最有名的成就是和其妻卡罗琳·休梅克（Carolyn Shoemaker）和戴维·利维（David H. Levy）共同发现休梅克－利维九号彗星（Shoemaker-Levy 9）。
1960年他就读于普林斯顿大学博士班时研究巴林杰陨石坑。他为了了解该陨石坑形成机制，特地到内华达试验场留下的坑洞进行调查。他发现了一个由冲击石英喷发物造成的环。1961年时他在亚利桑纳州的旗杆市成立美国地质调查局辖下的太空地质学研究计划（英语：Astrogeology Research Program）（Astrogeology Research Program）并出任首任主席。他对于探测月球的游骑兵计划有极大贡献；且该计划所拍摄的照片显示月球上有各种不同大小的撞击坑。他同时也协助训练美国太空人；而他也是阿波罗计划太空人的候选者，并可能原本是登陆月球的第一位地质学家，但因为被诊断出爱迪生氏病而未能如愿。因此他改负责在巴林杰陨石坑和落日火山口训练太空人。
1969年他到了加州理工学院以后开始研究阿波罗型小行星等近地小行星。这时他开始主张地质的突然变化是因为彗星、小行星等外来天体撞击，且外来天体撞击地球在地质时代中相当常见。在这之前就连月球上的撞击坑也大多被认为是死火山。
1984年他获得陨石学会表彰对撞击坑研究的巴林杰奖（英语：Barringer Medal）以及美国天文学会的杰拉德·柯伊伯奖，1992年他获得美国国家科学奖章。1993年他与其妻卡罗琳·休梅克（Carolyn Shoemaker）和戴维·利维（David H. Levy）在帕洛马山天文台使用18吋施密特摄星仪发现休梅克－利维九号彗星（Shoemaker-Levy 9）。这颗彗星让人类能首次观测彗星撞击行星。1994年7月这颗彗星撞击木星造成许多巨大的痕迹；在撞击前大多数科学家多认为对木星并无巨大影响。
休梅克晚年致力于在世界各地探险以发现过去被忽略的撞击遗迹。1997年7月18日他在澳洲进行研究时在爱丽丝泉西北的塔纳米路（Tanami Road）因为车祸身亡。1998年7月31日他的部分骨灰被放上了月球探勘者，装在由行星科学家卡罗琳·波尔科（英语：Carolyn Porco）设计的容器中。月球探勘者于1999年7月31日撞上月球结束任务，他是至今唯一葬在月球的人。
存放休梅克骨灰的容器刻上了休梅克－利维九号彗星、巴林杰陨石坑的图片。并有罗密欧与茱丽叶中的一段话：
