秘密印度教徒，是指公开声称另一种信仰但仍暗中坚持印度教信仰的人。这种人是在南亚强制改宗现象时出现，他们很多在被揭发仍信仰印度教时被杀。
一些在德里苏丹国担任官职的印度教徒被指控秘密追随印度教。例如从印度教皈依伊斯兰教的古吉拉特人库斯鲁汗和一名军队指挥官，他领导了对德干王国的掠夺性袭击，他的生命即将结束，“被突厥贵族指控怀有秘密信仰印度教倾向，这是一项虚假的指控，但反映了穆斯林统治阶级内部的派系分裂和偏见”。根据阿齐兹·艾哈迈德的说法，阿拉伯伊斯兰学者认为孟加拉（孟加拉国，西孟加拉邦）所遵循的伊斯兰教形式具有隐藏的印度教元素，并试图对其进行改革，以更严格地遵守阿拉伯半岛的版本。
印度果阿天主教皈依者秘密信仰印度教在1560年至1821年期间在葡属印度是刑事犯罪。一些土生土长的果阿人被指控，逮捕和审判，因为他们是秘密定印度教徒。
果阿宗教裁判所成立的最初对象是从伊比利亚半岛移民到果阿的假装改信天主教的塞法迪犹太人和北非穆斯林(摩尔人)。这两个社区被视为安全威胁，因为他们以企图联手推翻伊比利亚半岛的基督教统治者而闻名。在1560年至1623年间被定罪的1，582人中，有45.2%因与犹太教和伊斯兰教有关的罪行而被定罪(另有少部分是本地人)。所有被烧死的人都被判犯有信仰异教或鸡奸罪。
在印度分裂期间，许多旁遮普族印度教徒和马扎比锡克教徒皈依基督教，以逃避反印度教和锡克教的暴力。尽管宗教发生了变化，但这些社区仍然保持着许多原始的宗教信仰和习俗。尽管如此，宗教融合主义仍然存在于该国，一些穆斯林信徒继续参观印度教和锡克教圣徒的圣地。根据一份报告，印度教徒通过公开使用伊斯兰名字和私下使用印度教名字来隐藏他们的宗教的做法在伊斯兰马巴德是可行的。在巴基斯坦逗留期间，阿吉特·多瓦尔回忆起他与一位印度教徒的相遇，这位印度教徒公开过着毛拉韦的生活。
在爪哇，科贾文信仰是一种融合了万物有灵论，佛教，印度教和伊斯兰苏菲派传统的宗教。在2018年被政府承认前为独立宗教前被视为伊斯兰教。这种宗教有不少印度教-佛教元素。
