朱慈焕（1633年－1637年），为明思宗第五子，母亲是恭淑端惠静怀皇贵妃田氏，在民间有朱三太子之称。虽然事实上的朱慈炯才是“朱三太子”，但因民间称太子朱慈烺为“悼皇帝”，二子朱慈烜一出生就夭折，故三子朱慈炯被民众称为“朱太子”（其实是第三皇子），由此开始序齿，故四子朱慈炤称“朱二太子”，慈焕被称为“朱三太子”。有许多人自称是“朱三太子”，试图起义。如杨起隆案、王士元朱三太子案。
不过，聪明伶俐且能通灵的“五皇子”朱慈焕，比真正的朱三太子朱慈炯，显然在民间更具影响力。
崇祯六年（1633年）出生，是明思宗朱由检的第五个儿子。
崇祯十年（1637年），思宗因军用告急，向疏亲李国瑞（孝定皇太后的侄孙）征用银两不得，大怒，正要惩处李国瑞，思宗的外婆瀛国太夫人、岳父周奎、姑祖父王昺一齐入宫求情，明思宗将国瑞在狱中打死。此时朱慈焕已病笃，突然对明思宗说：“九莲菩萨（即孝定皇太后的尊称）说了：“皇上对外戚太差，要让皇子们统统死光。”随即死去。思宗大惊，在宫中对九莲菩萨大加祭祀，一连三天三夜。明思宗认为慈焕灵异，追封“孺孝悼灵王玄机慈应真君”，时礼科给事中李焻指不应以道教的真君名号作为皇子封号，这属于邪教，但思宗不理会，几年后，思宗还是改封了“宣显慈应悼灵王”，去除了“真君”之号。
野史传说朱慈焕并未病死，只是一度生病，梦见九莲菩萨欲杀尽皇子，但明思宗在宫中礼拜九莲菩萨之后，慈焕即病愈，甲申之变时，慈焕伪装为僧，逃至江南，继续反清复明，人称“朱三太子”。
甲申之变后，明朝宗室颠沛流离，无所考据，有一个名叫“王士元”的人，自称“朱三太子”（即朱慈焕），与很多士人有联络，后被官府所拘捕。
遭审问时，官府问他：“朝廷待汝不薄，何为谋反呢？” 答：“吾数十年来改易姓名，冀避祸耳，本朝有三大恩于前朝，吾感戴不忘，何尝谋反？” 官府问：“何为三大恩？”答：“本朝诛杀流贼，与我家报仇，一也。凡我先朝子孙，从不杀害（此条不实，借机乞怜），二也。 朱家祖宗坟墓，今上躬行祭奠，命人洒扫，三也。”“况吾今七十五岁，血气已衰，鬓发皆白，乃不作反于三藩之乱时，而反于清宁无事之日乎？且所谓谋反者，必占据城池，积草屯粮，招军买马，打造盔甲，吾曾有一于此乎？”官府认为辩解有理，将他软禁于一屋，并不用刑，上奏朝廷。
王士元自述身世为：他是定王朱慈焕，明甲申之变时，十一岁，崇祯帝把他交给王太监藏匿民间，王太监却把他交给流寇李闯，李闯命一个毛姓将军看守他，后来清兵入关，毛将军带着他出奔到河南种田，流离颠沛。十三岁时，毛将军听说清兵正在缉捕流寇余党，于是抛下他，自己逃亡了。他走到朱元璋故居凤阳，遇到一位姓王的老乡绅，曾任明朝谏官，细询根由，执手悲泣，乃留在王家，作为其养子，改姓“王”，取名“王士元”。
王谏官病故后，士元年方十八九，被王家子孙破门，至一佛寺中剃发出家，偷生度日，后结识一个姓胡的余姚人，亦明官员后裔，后两人谈艺论文后，胡颇钦佩他的才学，劝他还俗，并将女儿嫁给了他。自此以教书谋生，居于四明山，但是官府访查之下，他只好迁居山东，化名“张用观”，斋号“潜斋”，自称“浙东张老先生”。
康熙四十四年（1705年），士元化名“何诚”，在宁波向秀才张月怀租屋居住，不久，张月怀请士元饮酒畅谈，士元酒后狂悖，自称是崇祯皇子，月怀打算借此机会起义，拥立“朱三太子”，事情遭到官府侦查，士元大惊，便带家属徙居湖州长兴县。
康熙四十五年（1706年），一名僧人张念一听说了这件事，于是向檀越募集香火钱，自称要“助朱三太子起义”，士元又被官府追缉，后风声极紧，宁波、镇海都“一步一步挨查”，三子一孙被逮捕，士元和另外一个儿子流亡。士元一妻一妾、三个女儿、一个儿媳，均按照明思宗家法，全部上吊自尽，以免受辱。康熙四十七年（1708年），官府于张念一口供中，得悉士元行踪，遂把山东汶上的士绅李力远家教书的士元拘捕，押解京师受审，此时王士元已经七十五岁了。
朝廷大臣还是以“朱某虽无谋反之事，未尝无谋反之心，应拟大辟，以息乱阶。”为罪名将他处死，并以谋反罪，决议将其一家凌迟，上奏康熙帝，康熙认为凌迟太残忍，改为斩立决，儿孙全部斩首。
李力远则辩称：根本不知道自己家的家教老师是明朝皇子，自己曾当过县令，深受清朝的大恩，退万步言，就算是自己不顾念恩情，也害怕刑罚，如果遇到叛变头目一定会报告官府，更何况是如果要藏匿犯人，怎么可能公然让他留在家中，而不将他藏匿于深山野岭呢？如此可见，他是无辜的。朝廷认为李力远不可能不知情，但是从轻发落，将其一家“流放三千里”，发配到伯都讷。另外与朱三太子案有关的一百多人等，一律流放至宁古塔、齐齐哈尔等地。
三女
朱曾裕，朱和兟之子
