巴尔的摩病毒分类系统

巴尔的摩病毒分类系统（Baltimore classification）是一种由戴维·巴尔的摩建立的以基因组和病毒转录mRNA方式为区分的病毒分类系统。世界上的病毒千奇百怪，数量极多，生活周期又各具特征。病毒仅由基因组核酸和蛋白质组成，但是自己又没有蛋白质翻译需要的一系列条件，所以只能依赖宿主细胞的核糖体来翻译mRNA上的遗传信息。所以，病毒怎么样把它的基因组变成细胞能够识别的mRNA就是病毒生命周期中至关重要的环节。美国病毒学家David Baltimore根据不同的病毒基因组产生mRNA方式的不同进行了分类，这就简化了病毒特殊的生命周期的本质和内涵。首先是题图，病毒的基因组可以分为（从上到下）：双链DNA（double strand）、有缺口的双链DNA、单链DNA（single）、双链RNA、单正链RNA（positive）、单负链RNA（negative）、需要DNA中间体的单正链RNA。根据不同基因组形成mRNA步骤的不同可以大致分为：I、II、III、IV、V、VI、VII。I（双链DNA）、II（单链DNA）、III（双链RNA）、IV（正链RNA）、V（负链RNA）、VI（正链RNA需要DNA中间体）、VII（有缺口的双链DNA需要双链DNA中间体）。为了给深入的研究提供指导，根据病毒基因表达方式将病毒分为以下七个组：这类病毒通常只有在进入宿主细胞核之后才能进行自我复制。除此之外，这类病毒还需要宿主细胞核内的DNA聚合酶才能完成自我复制，因此它们很大程度上受宿主细胞的细胞周期影响。有效的感染与子代的产生都需要在宿主细胞进行复制时才能进行，因为病毒所利用的核内DNA聚合酶在此时是活跃的。此类病毒有可能诱发细胞快速裂解，导致细胞转变和癌变，如疱疹病毒、腺病毒和乳头多瘤空泡病毒。第一组中，唯一一类已充分研究且不在核内进行复制的例子是痘病毒科（一种有脊椎动物高发病率的病原体，包括天花病毒）。此类病毒使用普遍的mRNA转录方式——使用宿主相关的转录酶——合成两种mRNA：这一类病毒包括有：这类病毒中除了小DNA病毒 Parvoviruses 以外，所有物种都具有环形DNA。其中感染真核生物的病毒大多在宿主细胞的细胞核中，通过基圆机制？（英语：Rolling circle replication）构建双链DNA中间体，进行复制。一种流行的却没有临床症状的叫作“TTV”（Transfusion Transmitted Virus）的人类指环病毒（英语：Anellovirus） (Anellovirus)也包括在这一组中。跟大部分RNA病毒一样，这类病毒的复制在宿主细胞的细胞质中，并不需要像DNA病毒那样使用宿主的聚合酶。这一组中研究较多的是双核糖核酸病毒科（Birnaviridae 和呼肠孤病毒科（Reoviridae）。该组病毒的基因组为单顺反子（英语：monocistron），并且有一些病毒基因组只编码一个蛋白质（不像其它病毒有较复杂的转译过程）。(?)巴尔的摩病毒分类系统中的第四组和第五组为单链RNA病毒，根据病毒所带的RNA的正义或反义又可以细分成四五两组。拥有单链RNA是这两组病毒共同的特点，它们的复制在细胞质中，并且不受宿主细胞的细胞周期限制。该组病毒的RNA可以直接被宿主细胞中的核糖体识别并立即转译出蛋白质，而事实上所有正股的ssRNA都是如此。本组病毒还可以根据转译的方式细分为两类：本组病毒包括有：该组病毒的RNA不能直接被宿主细胞中的核糖体识别并立即翻译出蛋白质，而事实上所有反义的ssRNA都是如此，因此它们要通过自身的聚合酶合成正义ssRNA，从而才可以被宿主核糖体识别本组病毒也可以根据复制的方式细分为两类：两种病毒最大的不同在于核酸复制的位置不同。本组病毒包括有：一种被研究较多的，包括反转录病毒科 (Retroviridae) 的病毒，一个明显的特点是使用逆转录酶将(+)ssRNA转换成DNA，随后用整合酶将DNA整合到宿主的基因组中，此后就可以利用核内的聚合酶了。一小组以乙肝病毒 (Hepatitis B)【肝病毒科(Hepadnaviridae)】为典型的病毒，包含双链不闭环的DNA。该线型的DNA在闭环成为共价闭合环状DNA（cccDNA）后，作为模板转录mRNA和亚基因组mRNA（英语：subgenomic mRNA），随后由前基因组（英语：pregenome）表达的RNA做为模板逆转录出充当基因组的DNA。（请对照英文页面原文）医学导航: 病毒病病毒(蛋白质)/分类cutn/syst (hppv/艾滋病, 流感/疱疹/人畜共患)/人名体征药物(抗DNA, 抗RNA, 抗逆转录, 疫苗)