杨恩元(1875年-1952年),字覃生,别号三不惑斋主人,安顺人。清朝政治人物、进士出身。
光绪二十年,中举;光绪二十一年,登进士,同年五月,以主事分部学习,授礼部祠祭司主事。戊戌变法后辞职。后居乡不出仕,致力于当地文教。