吴善（1532年—1588年），字元夫，号南洲，福建漳州府龙溪县人，民籍，明朝政治人物。嘉靖壬戌进士，万历年间累官两广总督。
福建乡试第三十二名举人。嘉靖四十一年（1562年）中式壬戌科会试第一百二十八名，二甲第十五名进士。授刑部主事，升江西司署郎中事主事，万历元年（1573年）恤刑广东，多有平反。二年正月出为广西副使、永宁道兵备，六年四月升四川右参政，加按察使，七年十月补四川右参政、整饬建昌兵备兼管分巡粮储，八年正月升广西右布政使，九年八月升江西左布政使。万历十一年（1583年）三月，升应天府府尹，十一月以都察院右副都御史、巡抚广西。十五年二月升南京工部右侍郎，六月出任兵部右侍郎、总督两广军务、巡抚广东地方，次年积劳卒于任内。
曾祖吴迪浓；祖父吴瑞哲；父吴章禹，母徐氏。具庆下。兄神、岱。
