16S rRNA

✍ dations ◷ 2025-04-25 02:34:47 #16S rRNA
16S核糖体RNA(16S ribosomal RNA),简称16S rRNA,是原核生物的核糖体中30S亚基的组成部分。16S rRNA的长度约为1,542 nt。卡尔·乌斯和乔治·福克斯是率先在系统发育中使用的16S rRNA基因的两个先驱者。一个细菌的细胞中可包含多个具有不同序列的16S rRNA。已知16S rRNA具有如下几项功能:由于不同种的真细菌与古细菌间的16S rRNA基因(16S rDNA)是高度保守的,16S rDNA常被用于对各种生物进行的系统发生学方面的研究这种运用16S rRNA对生物进行系统发生学研究的方法由卡尔·沃斯(Carl Woese)开创。另外,线粒体和叶绿体中的rRNA也都被扩增了。在获得能提供系统发育学信息的16S rRNA分子时需要利用通用PCR引物对16S rRNA分子进行扩增。16S rRNA序列的对比分析需要在这类“通用引物”的脱氧核糖核酸分子的辅助下完成,这类分子具有如下序列:这类引物因并未在近期发现的几种属于纳古菌门(Nanoarchaeota)的热液古菌中分离识别出来,也被称为准通用引物。除了高度保守的引物结合位点之外,16S核糖体RNA基因序列包含高变区,可以提供具体物种的签名序列用于鉴定细菌的有用的。其结果是,16S核糖体RNA基因测序已经成为医学微生物学普遍的作为一种快速和廉价的鉴定细菌表型方法的替代方法。尽管它最初用于鉴定细菌,随后16S测序被发现能够重新分类细菌进入完全新的物种,或者甚至是属。它还已经被用于描述具有从未被成功培养的新物种。因为它存在于大多数微生物并显示适当的变化,16S rRNA基因被用作分类鉴定微生物的标准。大多数细菌和古细菌的16S rRNA基因序列型菌株可在公共数据库得到,例如NCBI数据库。然而,在这些数据库中发现的序列的质量往往没有验证。因此,只收集16S rRNA序列辅助数据库被广泛使用。最经常使用的数据库如下:1) EzTaxon(英语:EzTaxon Database)-e. https://web.archive.org/web/20130928154318/http://eztaxon-e.ezbiocloud.net/2)核糖体数据库项目。http://rdp.cme.msu.edu/ 核糖体数据库项目(RDP)。3) SILVA.4) Greengenes. Greengenes是基于新生系统发生,提供了标准的操作分类单元集的质量控制,全面的16S参考数据库和分类。该网站的官方主页是http://greengenes.secondgenome.com,并在Creative Commons许可BY-SA3.0许可。

相关

  • NSK萨格勒布国家和大学图书馆(克罗地亚语:Nacionalna i sveučilišna knjižnica u Zagrebu,原称Nacionalna i sveučilišna biblioteka u Zagrebu)是克罗地亚的国家图书馆,也是萨
  • 双链DNA病毒脱氧核糖核酸病毒(英语:DNA virus),又称DNA病毒,其遗传物质为DNA。一般为正链DNA病毒。医学导航: 病毒病病毒(蛋白质)/分类cutn/syst (hppv/艾滋病, 流感/疱疹/人畜共患)/人名体
  • 路易·布莱叶路易·布莱叶(法语:Louis Braille,发音:.mw-parser-output .IPA{font-family:"Charis SIL","Doulos SIL","Linux Libertine","Segoe UI","Lucida Sans Unicode","Code2000","Gen
  • 古巴斯捷氏综合征古德巴斯捷氏综合征(Goodpasture syndrome,GPS),又称古德巴斯捷氏病(Goodpasture's disease)、肺出血肾炎综合征、抗肾小球基底膜抗体病(anti-glomerular basement antibody diseas
  • 青色青色又称绿蓝色,是指介于绿色和蓝色之间的颜色,波长大约为500-485奈米。青色可以是指黑色、绿色或蓝色,需根据前后文推断。在中国的五行学说中,青色是木的一种象征;青色在中国文
  • 超嗜热生物超嗜热生物指能在极热的环境(60°C以上)中生活的生物。其生长最适温度通常在80~110°C,而2003年发现的一株古菌“菌株121”甚至能在和灭菌锅相同的温度,即121°C下,24个小时内,细
  • 作品作品,亦称创作、创意成品、著作,是具有创作性,并且可以通过某种形式复制的成品。著作权法保障了这些创造性活动的表现形式。作品的创作者就是作者。作品的形式有很多种,不同的作
  • 古元古代古元古代(英语:Paleoproterozoic,符号PP)是地质时代中的一个代,开始于同位素年龄25亿年前(Ma),结束于16亿年前(Ma)。而古元古代期间蓝藻、细菌非常繁盛。古元古代属于前寒武纪元古宙,上
  • 担子菌担子菌门(学名:Basidiomycota)是一类高等真菌,构成双核亚界,包含2万多种,包括蘑菇、木耳等主要食用菌。更具体地说,担子菌门包括以下组:蘑菇,马勃,stinkhorns(鬼笔科),支架真菌(英语:Bracke
  • 磷酸盐磷酸盐(phosphate,符号:PO3−4),是磷酸的盐,在无机化学、生物化学及生物地质化学上是很重要的物质。磷酸盐离子是一个多原子的离子,其实验式是PO43−,而分子量是94.97。它包含一个磷