首页 >
16S rRNA
✍ dations ◷ 2025-07-02 11:00:20 #16S rRNA
16S核糖体RNA(16S ribosomal RNA),简称16S rRNA,是原核生物的核糖体中30S亚基的组成部分。16S rRNA的长度约为1,542 nt。卡尔·乌斯和乔治·福克斯是率先在系统发育中使用的16S rRNA基因的两个先驱者。一个细菌的细胞中可包含多个具有不同序列的16S rRNA。已知16S rRNA具有如下几项功能:由于不同种的真细菌与古细菌间的16S rRNA基因(16S rDNA)是高度保守的,16S rDNA常被用于对各种生物进行的系统发生学方面的研究这种运用16S rRNA对生物进行系统发生学研究的方法由卡尔·沃斯(Carl Woese)开创。另外,线粒体和叶绿体中的rRNA也都被扩增了。在获得能提供系统发育学信息的16S rRNA分子时需要利用通用PCR引物对16S rRNA分子进行扩增。16S rRNA序列的对比分析需要在这类“通用引物”的脱氧核糖核酸分子的辅助下完成,这类分子具有如下序列:这类引物因并未在近期发现的几种属于纳古菌门(Nanoarchaeota)的热液古菌中分离识别出来,也被称为准通用引物。除了高度保守的引物结合位点之外,16S核糖体RNA基因序列包含高变区,可以提供具体物种的签名序列用于鉴定细菌的有用的。其结果是,16S核糖体RNA基因测序已经成为医学微生物学普遍的作为一种快速和廉价的鉴定细菌表型方法的替代方法。尽管它最初用于鉴定细菌,随后16S测序被发现能够重新分类细菌进入完全新的物种,或者甚至是属。它还已经被用于描述具有从未被成功培养的新物种。因为它存在于大多数微生物并显示适当的变化,16S rRNA基因被用作分类鉴定微生物的标准。大多数细菌和古细菌的16S rRNA基因序列型菌株可在公共数据库得到,例如NCBI数据库。然而,在这些数据库中发现的序列的质量往往没有验证。因此,只收集16S rRNA序列辅助数据库被广泛使用。最经常使用的数据库如下:1) EzTaxon(英语:EzTaxon Database)-e. https://web.archive.org/web/20130928154318/http://eztaxon-e.ezbiocloud.net/2)核糖体数据库项目。http://rdp.cme.msu.edu/ 核糖体数据库项目(RDP)。3) SILVA.4) Greengenes. Greengenes是基于新生系统发生,提供了标准的操作分类单元集的质量控制,全面的16S参考数据库和分类。该网站的官方主页是http://greengenes.secondgenome.com,并在Creative Commons许可BY-SA3.0许可。
相关
- 单核球单核细胞(英语:Monocyte)是人体免疫系统中的一种白细胞,单核细胞产生于骨髓,在血管内为单核细胞,血管外就变成巨噬细胞。其在人体免疫系统内有两种作用:一,补充正常状态下的巨噬细胞
- 托马斯·哈克尔·韦勒托马斯·哈克尔·韦勒(Thomas Huckle Weller,1915年6月15日-2008年8月23日)是一位美国病毒学家。1954年,他与约翰·富兰克林·恩德斯、弗雷德里克·查普曼·罗宾斯一同被授予了诺
- 转录转录(英语:Transcription)是在RNA聚合酶的催化下,遗传信息由DNA复制到RNA(尤其是mRNA)的过程。作为蛋白质生物合成的第一步,转录是合成mRNA以及非编码RNA(tRNA、rRNA等)的途径。真核
- 黄疸黄疸(英:jaundice、icterus)又称黄胆,俗称黄病,是因为体内胆红素过高,造成皮肤及巩膜发黄或是发绿的症状,一般会伴随发痒、粪便苍白及尿液颜色偏深的情形。新生儿黄疸是出生后前三
- 羟甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶抑制剂羟甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶抑制剂(英语:HMG-CoA reductase inhibitors 或 Statins,简称“HMG-CoA还原酶抑制剂”或“他汀类药物”)是一类抗高血脂药。因他汀类有降低低密度脂
- 鲍氏不动杆菌鲍氏不动杆菌(学名:Acinetobacter baumannii,俗称:AB菌),属于革兰氏阴性菌,是一种严格需氧、非乳糖发酵的条件致病菌,不具鞭毛,移动性不高,但生命力极强,可广泛地存在于大自然中。该菌
- 蛙壶菌蛙壶菌(学名:Batrachochytrium dendrobatidis)是一种壶菌门真菌,可以引起两栖类的壶菌病。它们最初是于1998年发现,在其后的十年内,造成了大量两栖类的死亡,引发多个物种灭绝,是为全
- 储蓄宿主自然宿主(natural reservoir,亦作reservoir host),又名存储宿主、保虫宿主或储蓄宿主,是一个流行病学或感染性生态学(英语:disease ecology)的专有名词,指病原体天然栖息及繁殖,又或赖
- 卵巢卵巢(英语:ovary;拉丁语:ovarium)在解剖学中是指动物雌性体内制造卵子的一对性腺体。其中人类的卵巢呈现为卵圆形、偏灰的粉红色,是非常坚实的器官,形状类似于一个大葡萄。在子宫的
- 锌铜电池丹尼尔电池又称锌铜电池,是一种以锌为负电极;铜为正电极;硫酸锌与硫酸铜为电解液的电化电池,由约翰·弗雷德里克·丹尼尔(John Frederic Daniell)于1836年发明,丹尼尔电池一称来自