16S rRNA

✍ dations ◷ 2025-08-23 18:03:13 #16S rRNA
16S核糖体RNA(16S ribosomal RNA),简称16S rRNA,是原核生物的核糖体中30S亚基的组成部分。16S rRNA的长度约为1,542 nt。卡尔·乌斯和乔治·福克斯是率先在系统发育中使用的16S rRNA基因的两个先驱者。一个细菌的细胞中可包含多个具有不同序列的16S rRNA。已知16S rRNA具有如下几项功能:由于不同种的真细菌与古细菌间的16S rRNA基因(16S rDNA)是高度保守的,16S rDNA常被用于对各种生物进行的系统发生学方面的研究这种运用16S rRNA对生物进行系统发生学研究的方法由卡尔·沃斯(Carl Woese)开创。另外,线粒体和叶绿体中的rRNA也都被扩增了。在获得能提供系统发育学信息的16S rRNA分子时需要利用通用PCR引物对16S rRNA分子进行扩增。16S rRNA序列的对比分析需要在这类“通用引物”的脱氧核糖核酸分子的辅助下完成,这类分子具有如下序列:这类引物因并未在近期发现的几种属于纳古菌门(Nanoarchaeota)的热液古菌中分离识别出来,也被称为准通用引物。除了高度保守的引物结合位点之外,16S核糖体RNA基因序列包含高变区,可以提供具体物种的签名序列用于鉴定细菌的有用的。其结果是,16S核糖体RNA基因测序已经成为医学微生物学普遍的作为一种快速和廉价的鉴定细菌表型方法的替代方法。尽管它最初用于鉴定细菌,随后16S测序被发现能够重新分类细菌进入完全新的物种,或者甚至是属。它还已经被用于描述具有从未被成功培养的新物种。因为它存在于大多数微生物并显示适当的变化,16S rRNA基因被用作分类鉴定微生物的标准。大多数细菌和古细菌的16S rRNA基因序列型菌株可在公共数据库得到,例如NCBI数据库。然而,在这些数据库中发现的序列的质量往往没有验证。因此,只收集16S rRNA序列辅助数据库被广泛使用。最经常使用的数据库如下:1) EzTaxon(英语:EzTaxon Database)-e. https://web.archive.org/web/20130928154318/http://eztaxon-e.ezbiocloud.net/2)核糖体数据库项目。http://rdp.cme.msu.edu/ 核糖体数据库项目(RDP)。3) SILVA.4) Greengenes. Greengenes是基于新生系统发生,提供了标准的操作分类单元集的质量控制,全面的16S参考数据库和分类。该网站的官方主页是http://greengenes.secondgenome.com,并在Creative Commons许可BY-SA3.0许可。

相关

  • 外科医师人体解剖学 - 人体生理学 组织学 - 胚胎学 人体寄生虫学 - 免疫学 病理学 - 病理生理学 细胞学 - 营养学 流行病学 - 药理学 - 毒理学外科学是现代医学的一个科目,主要研究
  • 维生素维生素(英语:Vitamin)是一系列有机化合物的统称,曾依音译,称作“维他命”。它们是生物体所需要的微量营养成分,而一般又无法由生物体自己生产,需要通过饮食等手段获得。维生素不能
  • 糖尿病视网膜病变糖尿病视网膜病变(英语:Diabetic retinopathy)是糖尿病的并发症。长期的高血糖环境会损伤视网膜血管的内皮,引起一系列的眼底病变,如微血管瘤、硬性渗出、棉絮斑、新生血管、玻璃
  • 空气空气是指地球大气层中的气体混合。它主要由78%的氮气、21%氧气、还有1%的稀有气体和杂质组成的混合物。空气的成分不是固定的,随着高度的改变、气压的改变,空气的组成比例也会
  • 心律调节器心脏起搏器(英语:Pacemaker、Artificial pacemaker),又称心脏节律器,心脏起搏器,是一种医疗器材,使用电击对于心脏的肌肉做持续与规律的刺激,以维持心脏的持续跳动。1932年,美国的生
  • 螺旋动物螺旋动物(学名:Spiralia),又称螺旋卵裂动物,是原口动物的一大分支,包括多种型态的动物门类,如软体动物、环节动物门、扁形动物门等。其动物在发育的早期过程中以经典的“螺旋式”卵
  • 葡萄球菌属葡萄球菌(学名:Staphylococcus)是一群革兰氏染色阳性球菌,因常常堆聚成葡萄串状而得名。广泛分布于自然界及人和动物的皮肤及与外界相通的腔道中。大部分是不致病的腐生菌。医务
  • 生态经济学生态经济学是一个跨学科的学术研究领域,旨在了解在不同时间和空间下,人类经济与自然生态间的共同演化和互相依存的关系。有别于环境经济学,环境经济学是对环境的主流经济分析,生
  • 氢氧化铜氢氧化铜(化学式:Cu(OH)2)是金属铜的氢氧化物。它是一种淡蓝色固体,某些市售的氢氧化铜中混有一些碳酸铜,颜色偏绿。氢氧化铜自从熔铜开始就已经为人所知。公元前5000年的炼金术
  • 食品卫生食物卫生是指一系列与食物的进食、烹调及保存相关的卫生常识。日常因饮食而引起的问题,主要都是因为细菌在食物滋长,从而引致食物中毒。透过下列的方法对食物卫生作安全监管,可