甲比丹（日文原名：カピタン，汉字写作：甲比丹、甲必丹、加比旦）为日本在江户时代（17世纪到19世纪期间）对欧洲在日本设立的“商馆”（贸易办事处）负责人的称呼。
由于欧洲最早来到日本贸易的是葡萄牙人，葡萄牙语中，商馆负责人被称为“Capitão”（意为首长），发音即为“甲比丹”。1633年，日本锁国后，荷兰人成为唯一的的欧洲贸易对象，但是日本人仍沿用原本的葡萄牙语发音“甲比丹”来称呼荷兰的商馆负责人。又因为荷兰人日本的商馆负责人为荷兰东印度公司所指派，而“甲比丹”的意思也变成专指荷兰东印度公司在日本负责人。而荷兰语中，派驻日本的商馆负责人则是被称为“Opperhoofden”。
1550年葡萄牙人在平户获得了贸易许可，成立了日本地一个欧洲设立的商馆－平户葡萄牙商馆；1570年进一步在长崎设立商馆。之后在西班牙人（1584年）、荷兰人（1609年）、英国人（1613年）也先后开始在平户建立了各自的商馆。
1623年英国在安汶岛事件（英语：Amboyna massacre）后，决定退出东南亚，也因此关闭了在日本的商馆。同时日本开始加强对欧洲传教士的管制，1624年关闭了西班牙的商馆，1639年因岛原之乱，日本驱逐所有葡萄牙人，关闭了葡萄牙商馆。最后仅存的荷兰商馆也在1641年被强至迁移到长崎的出岛，日本自此正式完成“锁国”，出岛的荷兰商馆也成为欧洲在日本唯一的往来机构。
1810年至1815年期间荷兰本土遭法国吞并，也波及到荷兰的海外殖民地南非、圭亚那、苏里南、印度、锡兰、马六甲、苏门答腊、摩鹿加及爪哇相继遭到英国攻占沦陷。期间英国的爪哇副总督斯坦福·莱佛士两次遣使长崎，提议由英国人来取代荷兰人在出岛的贸易，但是当时的甲比丹Doeff坚守荷兰在日本的利益，拒绝了莱佛士提出的贸易建议。
从1609年开始至1858年，荷兰先后在日本派任了166任甲比丹，一直到1858年，日本与荷兰签署日兰修好通商条约（日语：日蘭修好通商条約）后，荷兰关闭商馆，改设立荷兰驻日本领事馆，最后一任荷兰商馆的甲比丹也成为第一任驻日本总领事。
