蕃薯藔厅（ばんしょりょうちょう ）为台湾日治时期行政区划之一，范围东至未开发之原住民地，西至楠梓仙溪西面山系，南至荖浓溪，北至三脚南山系，厅治设于蕃薯藔街（今高雄市旗山区），下辖杉林支厅，后改为阿里关支厅。其辖区包含现今高雄市旗山区、美浓区、田寮区、燕巢区部分、内门区、杉林区、六龟区、甲仙区和台南市南化区部分。
1897年5月，六县三厅制的行政区划公布，蕃薯藔地区隶属于台南县，下设有“蕃薯藔辨务署”，管辖罗汉内门庄、罗汉外门庄、崇德东里、楠梓仙溪东庄，并在同年7月开署。1898年3月，台湾行政区划改为三县三厅，蕃薯藔辨务署的管辖范围加入原由噍吧哖辨务署所属的楠梓仙溪西庄、噍吧哖庄、内新化南里。1900年3月，蕃薯藔辨务署的管辖范围加入原由阿公店辨务署所属的嘉祥内里，和原由阿缑辨务署所属的港西上里的弥浓、龙肚、新威、月眉和旗尾地区。
1901年11月，因办务署负责地方政务，而县及厅介于总督府与办务署之间，造成行政事务上的欠缺灵活，而废止“三县四厅”，设“二十厅”之行政单位，划分台南县为嘉义、盐水港、台南、蕃薯藔、凤山、阿猴等六厅。1904年4月，港西上里的中坛一带自阿缑厅划入蕃薯藔厅。1906年2月，山杉林支厅迁至阿里关庄甲仙埔，并改称为“阿里关支厅”。1907年12月，关支厅的沟坪区划入蕃薯藔厅直辖。
明治42年（1909年）10月，台湾总督府将原有之二十厅，废止合为十二厅，蕃薯藔厅废止，与恒春厅并入阿缑厅，原范围分划为甲仙埔、六龟里、蕃薯藔等三支厅。1920年10月，原蕃薯藔厅管辖的地区被划分为旗山郡（旗山街、美浓街、甲仙庄、杉林庄、内门庄、田寮庄）、屏东郡六龟庄与台南州新化郡南化庄部分；1932年，六龟庄划入旗山郡，田寮庄则划出予冈山郡。
1909年5月28日，蕃薯藔厅罗汉外门里蕃薯藔街街庄长陈顺和与人民代表庄涂，上书给台湾总督佐久间左马太，希望地名改为“太平街”。之后蕃薯藔厅厅长石桥亨派吏属小岛宗三郎与通译生尾亨进行调查，其结果除报告“太平”（名称由来据该调查书表示是因为此地有旗尾山与鼓山，“旗鼓相当”呈现太平气象）与“蕃薯藔”之名的由来外，还提出记载此地为“太平庄”的古文件与古文物，另外更报告当地有居民觉得此名称不雅（理由如食番薯者大多是粗鄙之人，藔字会联想到猪藔、乞丐藔等等），但蕃薯藔一名仍持续使用到1920年7月时才被“旗山”（旗山街）给取代。
港西上里：旗尾庄（旗尾庄、仑仔顶庄、匏仔湖庄）
崇德东里：古亭坑庄（古亭坑庄、梹榔脚庄、牌仔路头庄、下茅草山庄、上茅草山庄、梹榔宅庄、大滚水庄、应菜龙庄、石山仔庄）、狗氲氤庄（小滚水庄、狗氲氤庄、新路仔庄、松仔脚庄）
楠梓仙溪东里：新庄（隘丁藔庄、新庄、旧匠藔庄）
蕃薯藔厅所属的番地及蕃社如下：
台北县 · 台湾县（1895年改为台湾民政支部，1896年改为台中县） · 台南县（1895年－1896年改为台南民政支部） · 澎湖岛厅
台北县 · 新竹县 · 台中县 · 嘉义县 · 台南县 · 凤山县 · 宜兰厅 · 台东厅 · 澎湖厅
台北县 · 台中县 · 台南县 · 宜兰厅 · 台东厅 · 澎湖厅 · 恒春厅（1901年由台南县分出）
宜兰厅 · 基隆厅 · 台北厅 · 深坑厅 · 桃园厅 · 新竹厅 · 苗栗厅 · 台中厅 · 彰化厅 · 南投厅 · 斗六厅 · 嘉义厅 · 盐水港厅 · 台南厅 · 凤山厅 · 蕃薯藔厅 · 阿缑厅 · 恒春厅 · 台东厅 · 澎湖厅
宜兰厅 · 台北厅 · 桃园厅 · 新竹厅 · 台中厅 · 南投厅 · 嘉义厅 · 台南厅 · 阿缑厅 · 台东厅 · 花莲港厅 · 澎湖厅
台北州 · 新竹州 · 台中州 · 台南州 · 高雄州 · 台东厅 · 花莲港厅 · 澎湖厅（1926年由高雄州分出）
