涡虫分泌细胞网巢病毒

✍ dations ◷ 2025-09-15 03:58:46 #涡虫分泌细胞网巢病毒

涡虫分泌细胞网巢病毒(Planarian secretory cell nidovirus,简称PSCNV)是感染涡虫的一种网巢病毒,在地中海涡虫的转录组中发现,于2018年发表,国际病毒分类委员会(ICTV)将其归为网巢病毒目Mononiviridae科属下的涡虫网巢病毒一型(),为该单型科唯一的病毒。此病毒的基因组共长41,103nt,为已知基因组最大的RNA病毒。

涡虫分泌细胞网巢病毒的基因组长41,103nt,比同属网巢病毒目的冠状病毒基因组(27,000-32,000nt )还大,也大于当时所知基因组最大之RNA病毒球蟒网巢病毒(BPNV)的33,500nt,为目前已知RNA病毒中基因组最大者。

绝大多数网巢病毒基因组包含数个开放阅读框(ORF),包括ORF1ab(英语:ORF1ab)与其后方编码其他蛋白的若干3'端开放阅读框,但涡虫分泌细胞网巢病毒仅含有单一长40,671nt的开放阅读框,编码一个由13,556个氨基酸组成的多聚蛋白,为已知RNA病毒编码最大的蛋白,远大于次大者。此开放阅读框的前端有长128nt的5'UTR,后端则有长304nt的3'UTR,共同组成长41,103nt的基因组。

PSCNV病毒的基因组与其他网巢病毒ORF1a、ORF1b和3'端序列同源的区域中,以ORF1b区域长度增长的幅度最大,可能与其演化过程中基因组扩增的机制有关,ORF1b编码的蛋白许多为基因组复制过程所需,现行关于网巢病毒基因组演化的“三阶段模型”(three-wave model)认为部分网巢病毒共祖的ORF1b曾发生扩增,获得了具校对功能的RNA外切酶ExoN,因此可降低基因复制的突变率,使基因组其他区域也得以扩增,但曾发生此扩增的网巢病毒(如冠状病毒)基因组均在30,000nt左右止步,未有超过34,000nt者,且其ORF1b的大小均十分接近,涡虫分泌细胞网巢病毒作为唯一一种基因组大幅超过此长度的病毒,可能是ORF1b发生了第二波扩增,进而使基因组各区(ORF1a与3'端序列)继续扩增而达到目前的长度。

典型网巢病毒的ORF1ab由ORF1a与ORF1b组成,ORF1a的末端有滑动序列(英语:Slippery sequence)与假结结构,可使部分核糖体发生-1核糖体移码而继续翻译ORF1b,因此控制ORF1a与ORF1b蛋白的相对表现量,使ORF1a的蛋白表现高于ORF1b。涡虫分泌细胞网巢病毒的基因组虽只有一个开放阅读框,但其与ORF1a同源的区域末段也有一段会造成-1核糖体移码的序列,可使部分核糖体发生移码而在不久后结束翻译,因此达成与其他网巢病毒一样使ORF1a蛋白表现量高于ORF1b的效果。

涡虫分泌细胞网巢病毒的多聚蛋白包括至少20个结构域,大多对应网巢病毒典型的蛋白,另有4个为此病毒独有,不见于其他网巢病毒中。3CL蛋白酶(英语:3C-like protease)为网巢病毒ORF1a编码的蛋白之一,可将多聚蛋白切割成数个蛋白,PSCNV病毒的3CL蛋白酶活性位点的氨基酸与其他网巢病毒的稍有不同;此病毒负责校对的DNA外切酶ExoN缺少了其他网巢病毒ExoN均有的一个锌指结构域,反与细胞生物的外切酶较为接近,研究人员推测此锌指可能会限制ExoN的校对功能,PSCNV病毒的ExoN无此锌指可能可增加其复制的准确度,而有助于基因组的扩增。另外PSCNV病毒的RNA复制酶(RdRP)与核苷酸基转移酶(NiRAN)也各有一个关键位点的氨基酸不同。

此病毒独有的4个蛋白结构域包括一个RNA酶T2(英语:Ribonuclease T2)结构域、两个二型纤连蛋白(FN2a与FN2b)结构域以及一个锚定蛋白(英语:ankyrin)结构域,其中锚定蛋白结构域的序列与地中海涡虫和另一种涡虫的锚定蛋白序列相似,可能来自涡虫的细胞基因。

涡虫分泌细胞网巢病毒为研究人员在地中海涡虫的转录组中与网巢病毒相关的序列时发现,且出现于数个不同的转录组中,彼此序列的相似度很高,显示此病毒对实验室涡虫的感染可能相当普遍,且无性或有性的涡虫品系皆可被感染。后续的原位杂交实验显示此病毒可感染地中海涡虫用于分泌黏液的分泌细胞。

研究人员在转录组数据库中查找与PSCNV病毒相似的序列,发现另一种涡虫可能也被与此病毒相似的病毒感染。

支序分析结果显示涡虫分泌细胞网巢病毒为感染无脊椎动物的网巢病毒演化支的基群,为中套病毒科与杆状套病毒科的姊妹群,被归入网巢病毒目中新的单型科Mononiviridae。

相关

  • 5f13 7s22, 8, 18, 32, 31, 8, 2主条目:钔的同位素钔是一个人工合成元素,化学符号为Md(曾作Mv),原子序是101。钔是锕系元素中具有放射性的超铀金属元素,在锕系元素排倒数第三位、
  • 孤立脑孤立脑是大脑在脱离身体一部分或者死亡后用人工血继续In vitro生存并且连接到电脑中。是一种可能会有的科技。总之这样的人就可能可以好像不老不死的继续存在,而且可能可以有
  • 太室阙太室阙位于河南省登封市嵩山南麓中岳庙前500米处,是中岳庙具有象征意义的大门。属于礼制建筑。太室阙坐北面南,分东、西两阙,中间距离6.75米。阙高3.965米,每阙由连在一体的母阙
  • 区域菊石区域菊石(学名:),又名恩德莫菊石,是生存在白垩纪海洋中的一属菊石。它们是区域菊石超科的代表属,但其化石却相当地稀有。其化石被发现于德国及波兰等地。区域菊石和与其同科的其他
  • 2005-06球季英格兰足总杯2005/06球季英格兰足总杯(英语:FA Cup),是第125届英格兰足总杯,今届赛事的冠军是利物浦,他们在决赛以互射十二码3:1击败韦斯咸,夺得冠军。在法定时间赛和3:3,在决赛,谢拉特凭远射在最
  • 功之怒《功之怒》(英语:)是一部2015年瑞典武侠动作喜剧短片,由大卫·桑德伯格执导、编剧和主演。该片是向80年代的武侠片及警察动作片致敬。本片是从2013年12月到2014年1月间透过Kicks
  • 太空探险公司太空探险公司(Space Adventures)美国的太空旅游公司,埃里克·C·安德森成立于1998年弗吉尼亚州。截至2010年,太空探险公司产品包括零重力飞行,轨道航天飞行和其他有关飞行,其中包
  • 建宁右卫建宁右卫是明代至清初的一处卫所。洪武八年(1375年)十月置,治所在今福建省建瓯市城西,属福建行都指挥使司管辖,领浦城千户所。清朝顺治十八年(1661年)废。
  • 丁振麟丁振麟(1911年-1979年),男,浙江余杭人,中华人民共和国植物学家。早年考入浙江大学农学院农艺系,毕业后供职于南京中央大学农学院、金陵大学农学院、云南大学农学院等。1945年1月,考取公费赴美国,先后在爱荷华农工学院与康奈尔大学做研究,次年回国任浙江大学农学院农艺系教授兼农场主任。1952年,任浙江大学农学院教授兼副院长,之后历任浙江农学院副院长、浙江省农业科学院副院长、院长。著有《野生河栽培大豆的遗传研究》、《作物产量形成与高产理论》、《作物栽培学》、《近代玉米育种法》等。
  • 前691年