首页 >
NCBI
✍ dations ◷ 2025-08-27 04:34:11 #NCBI
国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,简称NCBI)是美国国家医学图书馆(NLM)的一部分(该图书馆是美国国家卫生研究所的一部分)。NCBI位于美国马里兰州的贝塞斯达,建立于1988年。NCBI设置有与生物技术和生物医学相关的一系列数据库,是生物信息学工具和服务的重要资源。 主要数据库包括DNA序列GenBank,和生物医学文献书目数据库PubMed。 其他数据库包括NCBI表观基因组数据库(英语:NCBI Epigenomics)。 所有这些数据库都可以通过Entrez搜索引擎在线获取。许多受尊敬的研究者在NCBI工作,如比较基因组学领域的一位多产的科学家Eugene Koonin和BLAST序列数据库搜索算法的作者Stephen Altschul。NCBI在研究数据库r3data.org的注册表中列出。NCBI自1992年开始负责维护DNA序列数据库(英语:Biological databases)GenBank。GenBank数据库每日都会实时更新并和另外两家数据库(欧洲的EMBL与日本的DDBJ)交换数据,以确保三家数据库的序列数据的一致性。
自1992开始,NCBI陆续将其它数据库与GenBank整合起来,包括Gene(英语:Gene (database))、在线人类孟德尔遗传数据库、 分子模型数据库(一个蛋白质三维结构数据库)、dbSNP(一个单核苷酸多态性数据库)、Reference Sequence Collection(一个人类基因组图谱)以及分类学浏览方式和美国国家癌症研究所提供的癌症基因组剖析计划(英语:Cancer Genome Project)数据。NCBI也对每一个物种都设立了一个分类编号(taxonomy ID number)。NCBI提供的一些在线软件可供FTP或WWW浏览,比如BLAST序列相似性比对程序,可在15秒内完成与GenBank数据库的序列比较。NCBI书架是一个集合了可以自由获取、下载的线上精选生物医学书籍数据库。截至2011年4月,书架有845本书籍,涵盖广泛的主题包括分子生物学、生物化学、细胞生物学、遗传学,和微生物学。从分子和细胞从角度分析的疾病状态、研究方法,和病毒学。一些书是以前出版的图书的在线版本,而其他如Coffee Break(书)是由NCBI的工作人员编写和编辑。书架是同行评审的Entrez PubMed库的期刊摘要的补充,因为它能提供前沿领域的已确立的的观点,并整理许多不同的零散的研究报告。BLAST是用于计算生物序列之间的序列相似性的算法,例如DNA的核苷酸序列和蛋白质的氨基酸序列。BLAST是查找与同一生物体内或不同生物体中的查询序列相似的序列的有力工具。 它搜索NCBI数据库和服务器上的查询序列,并将结果以选定的格式发布回该人员的浏览器。BLAST的输入序列大部分采用FASTA或Genbank格式,而输出可以以各种格式(如HTML,XML格式和纯文本)传送。 HTML是NCBI网页的默认输出格式。 NCBI-BLAST的结果以图形格式显示,找到所有命中结果,具有具有得分相关数据的命中结果的序列标识符的表格,以及感兴趣序列的比对以及用于这些的类似BLAST得分的命中结果。Entrez全球查询跨数据库搜索系统在NCBI中用于所有主要数据库,如核苷酸和蛋白质序列,蛋白质结构,PubMed,分类学,完整基因组,OMIM等。Entrez是既具有生物医学研究来源的数据的索引和检索系统。NCBI于1991年分发了第一版Entrez,由蛋白质数据库(PDB)和GenBank的核苷酸序列,SWISS-PROT,翻译的GenBank,PIR,PRF和PDB的蛋白质序列组成,PubMed的相关摘要和引文。 Entrez专门设计用于将来自不同来源,数据库和格式的数据集成到统一的信息模型和检索系统中,可以有效地检索相关的参考文献,序列和结构。
相关
- 生命征象生命体征(英语:Vital signs),或称生命迹象,医学术语,是一组4到6个最重要的人体基本生理功能(维持生命)的表征。这些测量结果被用于评估个体的身体健康,提供潜在疾病的线索,并显示出
- 抗病毒药物抗病毒药物(antiviral drug)是一类用于特异性治疗病毒感染的药物。就像抗生素治疗细菌感染一样,特定的抗病毒药物对特定的病毒起作用;但抗病毒药物和抗生素不同的是,后者消灭细菌
- 胸部创伤胸部创伤,是指对胸部的任何形式的物理伤害,对象包括但不限于肋骨、心脏和肺部。胸部创伤占所有创伤性死亡人数的25%。大多数钝器造成的损伤可通过相对简单的措施进行处理,如气管
- 呼吸系统呼吸系统(英语:respiratory system)指生物体内将呼吸气吸入体内并进行气体交换的系统。在人类和其他哺乳动物体内中,呼吸系统包括呼吸道、肺和呼吸肌。氧气与二氧化碳在呼吸系统
- 喉囊肿喉囊肿(laryngeal cysts)是指囊肿发生在喉部、或更频繁使用的声门上之位置,诸如“会厌谷囊肿(epiglottic vallecula cyst)”发生在会厌旁谷(英语:Vallecula)里的现象。通常喉囊肿
- 肿瘤学人体解剖学 - 人体生理学 组织学 - 胚胎学 人体寄生虫学 - 免疫学 病理学 - 病理生理学 细胞学 - 营养学 流行病学 - 药理学 - 毒理学肿瘤学(英:Oncology)是一种研究肿瘤(尤其
- 自然医学自然医学(英语:Naturopathy,或Naturopathic Medicine),又称自然疗法,起源于19世纪欧洲的非主流医疗方式,通常被归类在替代医学中。自然医学把人体视为一个整体,相信人体存在生命力,有
- 病理生理学人体解剖学 - 人体生理学 组织学 - 胚胎学 人体寄生虫学 - 免疫学 病理学 - 病理生理学 细胞学 - 营养学 流行病学 - 药理学 - 毒理学病态生理学是一门相对比较新的医学科
- 磷3s2 3p32, 8, 5蒸气压((白磷))第一:1011.8 kJ·mol−1 第二:1907 kJ·mol−1 第三:2914.1 kJ·mol−1 (主条目:磷的同位素磷(拉丁语:Phosphorum,化学符号:P)是一种化学元素,它的原子
- 子实体在真菌学中,子实体(英语:Sporocarp、fruiting body)是高等真菌产生的多细胞的有性产孢结构,其上附有产孢的子囊、担子等构造。子实体是真菌生活史中的有性阶段,无性阶段则是营养生