菲律宾政府(英语:Government of the Philippines)亦称菲律宾国家政府(Philippine National Government ),是菲律宾共和国的单一制政府,实行总统制、代议民主制及共和制,首都设在马尼拉,主要政府部门、行政、立法及司法机关皆设在马尼拉。
菲律宾总统为国家元首及政府首脑,自1987年起为单一任期六年,不能连任。不过,若总统在该单一任期中未有完成任期的一半而辞职,则可以再次参选,如埃斯特拉达。
菲律宾国会实行两院制,设参议院和众议院。参议院有24席,每三年改选三分之一议席。众议院有292席,每三年改选约一半议席。