日本原子能研究开发机构(英语:Japan Atomic Energy Agency, 日语:日本原子力研究开発机构, 缩写: JAEA)成立2005年10月1日,由前两个半政府组织的合并。虽然它继承了PNC和JAERI两个组织的活动,它也继承JAERI的绰号,“Genken”原研,缩写意为“核研究”。它是原子能有关的国立科研行政法人。
2007年4月10日,JAEA正式加入全球核能伙伴关系联盟(英语:Global Nuclear Energy Partnership)(GNEP)。在联盟的其他成员是法国阿海珐,华盛顿国际集团(英语:Washington Group International)和BWX。据预计,从六所村离心机浓缩厂获得的经验将是JAEA的一个重要贡献。
下面是它的活动的不完全名单,按地点来分类。
JAEA拥有位于茨城县东海村的多种设施,这里是日本核研究的第一个中心。目前,JAEA已扩大到在茨城县以及全日本的几个其他地点。
JAEA在福井县敦贺市另一个总部基地。它拥有快中子增殖反应堆中心和研发中心。
大洗研发中心(大洗研究开発センター)位于茨城县大洗町,接近于但不是在同一个地点东海村。它安置Jōyō核反应堆(英语:Jōyō (nuclear reactor))(试验的钠冷快中子反应堆),日本材料试验反应堆(英语:Japan Materials Testing Reactor),新的高温实验核反应堆(英语:HTTR)(HTTR),反应环境监测中心,和儿童博物馆。
这是一个小型的铀提炼和转化工厂,以及位于冈山县上斋原的小型离心浓缩示范厂。该中心研究应对核燃料循环的前端问题。