1301年,因宋代里护塘已经被海水侵蚀,故从漴缺开始建设新的海塘,后人称为元大德海塘。1473年,这段海塘曾全线重修。
因该集镇曾靠近杭州湾海边,此处曾是抗倭前线。嘉靖32年(1553年)十月,一百多名倭寇由此登岸,劫掠了戚木泾、金山卫等地,嘉靖33年正月,倭寇再次侵略松江府沿海地区。同年的农历三月二十七日,九十余名倭寇登陆漴阙,直抵松江府城,焚烧了大量粮仓中的粮食,童元、李丛禄战死。1575年五月底,受海宁海啸影响,大风吹起潮水,漴阙海塘决堤,房屋被冲垮,几万人死亡,海水浸没了田地,以至于变成了盐碱地。
1634年,漴缺附近的塘段被大潮冲开,决口堵住后,松江知府方岳贡、华亭知县张调鼎决定在决口、决口两侧和东尽塘二处改建石海塘,工期一年,这是上海首次出现料石塘。1640年,料石塘段两侧土塘又被海潮冲溃,因此又续筑石塘,当年9月动工,工期16个月。1640年,料石塘段两侧的土塘,又被海潮冲决,遂在决口处续筑石塘。当年农历九月动工,历时16个月。
1684年,江海关初设置于此,后因用房狭小,两年后移治上海县。
1726年,建设捍海石塘,西到漴缺,东到堰墩湾。
1937年11月,日军在沿海登陆,王子隆的军队进行反抗,漴阙免于战火。日军占领上海后,常常来骚扰,且盗匪出没,大量人口外迁,只有贫困农户居住。1950年,以梅林泾为界,该村划入奉贤县胡桥乡,后划入柘林镇。该集镇曾是奉贤县海滨医院的驻地,该院专治麻风病、传染性肝炎病患者。