多个共产主义政权下发生了反人类罪行。像强制驱逐、恐怖、种族清洗及乌克兰大饥荒及大跃进期间故意的饥馑被描述为危害人类罪。2008年关于欧洲良知和谴责共产主义罪行布拉格宣言宣称共产主义政权下的罪行通常是危害人类罪，根据纽伦堡审判中发展出的定义，以及共产主义与纳粹主义下的罪行的相似性。极少数人被判有此类罪行，即使爱沙尼亚、拉托维亚和立陶宛通过法律允许指控的波罗的海人民犯下罪行的肇事者。他们在1940及1941年苏联占领波罗的海国家期间，以及战后继续占领行动期间犯下罪行。他们还在内务人民委员部（NKVD）对森林兄弟的攻击中犯下罪行。
学术上一致认定波尔布特领导下的红色高棉在被称为杀戮战场的地方造成的柬埔寨种族灭绝是危害人类罪。法律学者Antoine Garapon、David Boyle和社会学家Michael Mann及政治科学教授Jacques Semelin认为柬埔寨共产党的行动最好描述为危害人类罪而非种族灭绝。1997年柬埔寨首相向联合国寻求帮助审判1975至1979年间共产党人犯下的罪行。同年6月波尔布特在红色高棉的内部斗争期间被拘禁并被公之于国际社会。然而没有国家寻求引渡。红色高棉下达的政策造成四年间四分之一人口的死亡。
在议会前的演讲中，罗马尼亚总统特莱扬·伯塞斯库声称“罪恶且非法的前共产政权犯下了大量侵害人权及危害人类罪，1945至1989年间杀死和迫害多达两百多万人。”这篇演讲基于马里兰大学教授Vladimir Tismaneanu领衔的总统委员会的660页报告。报告还称“该政权通过暗杀和驱逐成千上万人处决民众，”还特别提到皮特什蒂实验。Gheorghe Boldur-Lăţescu也说皮特什蒂实验是危害人类的罪行，而且Dennis Deletant描述其为
一个荒诞的原创性的实验……运用滥用精神医学的技术不仅设计用于对统治下的反对者反复灌输恐慌，也摧毁个人的人格。实验的本质及罪恶……使罗马尼亚有别于其他东欧政权。
三名朝鲜古拉格体系的受害者在被绑架者及朝鲜难民人权公民同盟的帮助下试图让金正日受到审判。2010年12月他们在海牙递交起诉书。朝鲜的古拉格体系造成估计有380,000至1百多万人的死亡，不符合种族灭绝或危害人类罪的定义。非盈利组织Christian Solidarity Worldwide声称古拉格体系的出现专门设计用于杀死大量被定为敌人或者政治信仰不同的人群。
