牧师是指基督教的团体中，管理教务，主持各项礼仪、讲道，专职牧养及照顾信徒的神职人员。圣经原文的用字就是牧羊人之意。虽然罗马天主教也有类似职位，但“牧师”一词在中文语境中特指新教的基层神职人员。
牧师的一词源于德语的，而希腊文为，与《圣经·以弗所书》4:11有关，“他所赐的有使徒、有先知、有传福音的、有牧师和教师”。
虽然在汉字文化圈中按立教士普遍被称为牧师，但在西方语系中则完全不同。苏格兰系改革宗教会中的已按立教士称之为“教师（Dominie）”，美国系循道宗则称之为“长老”，圣公会与罗马天主教和东正教相同均称为“祭司（priest）”；日本圣公会则否决中文的牧师一词而翻译为“司祭”，在日韩地区部分圣洁运动的教派也使用“福音使（Fukuinshi）”一词。英国或其他国家的国教教会牧师，英文称之为“Minister（会长）”；如果是指非国教教会的牧师，一般英语称之为Pastor；西方语系中头衔一般使用Reverend。
最初，基督宗教在第一世纪后受到不同地方的文化和习俗的影响，逐渐地将长老和监督的职务自一般信徒分离出来，成为圣职制度，然后将监督提升到高于长老的地位，称之为主教，而将长老置在主教之下，在英文称为祭司（priest），在这个时候开始，主教可以监督教区的司铎、教会和平信徒。
宗教改革后，加尔文、慈运理和其他改革者以牧师一词（pastor）取代罗马天主教的神父（priest）称呼。及后，长老制及会众制的教会出现并不再设立主教的圣职，牧师成为普遍基督教教会的基层神职人员。
在新教，特别是在清教徒背景所产生教派中，认为牧师（pastor）、长老（elder）和监督（bishop、overseer）指的是同一个职位。在主教制的教派里，牧师上一级是主教，下一级是会吏。而在会众及长老制度的教会中，堂主任是教会的主要决策者。
牧师可以经历爱情和婚姻（部分教派或基督宗教团体存在修会制度，具有修会会士身份的牧师需要遵守独身、对所属教团服从、不能拥有私人财产）。在东亚或华人教会文化中，其妻在教会被称为“师母或牧师娘”，其夫被称为“师丈”。
一般来说，每间新教教会最少有一名牧师。在部分缺乏资源地区及华人教会，若教会缺少牧师就会由传道人带领；若传道人亦无，则由执事或长老所管理。也有一些宗派或独立教会的神学理论中，认为牧师制度违背了信徒皆祭司的教义，因此拒绝使用相关词汇和教士聘用制度。
天主教会中的基层司牧一职，称为“本堂神父”或“主任司铎”，由具有神品的神父担任，主要工作为管理堂区并牧养堂区内的“羊群”（即平信徒）。在英语中称为“parish priest”。
在宗派教会，牧师的学术资格一般持有一个神学院或大学神学系神学学士学位，但部分如圣公会、信义宗、改革宗等教派会要求受职人就读或补充其所属教派的神学院课程，同时，部分宗派容许女性可以成为牧师，但另一方面持保守主义的教会明文规定或机制上出任牧师者只有男性。 部分持基督教基要主义、自由主义神学、五旬节运动、灵恩派、浸礼宗、福音主义等背景的教会会按立或接受没有神学学位的长执或领袖为牧师。更有部分独立教会甚至否定神学院制度并不接受神学生成为教士，推崇师徒制度或教会自行制定的神学课程训练准牧师。一般而言，被按立的候选人一般由教会推荐，再经由几名资深牧师所组成的委员会评审及格后才被按立，而牧师的圣职身份具有终身性，但若其信仰或道德行为出现严重违反戒律的情况，其所属教会或教派是有权利褫夺其牧师衔头。
堂主任（或称主任牧师、会牧、牧师等）为一所教会的管理者。会众多的教会，还有助理牧师、副牧师、传教师、传道师、传道、助理传道等。部分教会缺乏专任者，而有顾问牧师或义务牧师。
在小规模的教会，通常是会友奉献、配偶或自己在外的兼职等。
现今在线上游戏及文学作品中，常出现“牧师”一职业，如魔兽世界。通常线上游戏中的牧师是担任治疗者的角色，借由神圣的咒语和魔法达到补血、驱魔、复活等功能。相较于其他职业多半是为敌方带来损伤，牧师则是为友方提供增益、治疗，在游戏中的角色扮演。
在新兴宗教，统一教的基层神职人员也被称为牧师。其他如山达基的“牧师”，其性质完全不同。
牧师、执事在礼仪上所佩戴的圣带
宗教改革后的牧师
梁发，首位华人基督教牧师
长老教会牧师举行升任牧师的“封牧仪式（按立礼）”。
现代教士便服上的罗马领
美军的从军军牧
在公祷崇拜的圣公会牧师，为非主持圣礼时穿着的歌咏大礼服（英语：Choir dress）
身穿日内瓦袍的牧师，路德宗、改革宗等众多教派使用
身穿长白衣披戴圣带的牧师，起源自天主教，多为圣公宗、路德宗、循道宗使用
在圣坛上主持圣餐礼的牧师
在圣坛上主持圣餐礼的牧师
崇拜前牧师走入礼拜堂进场礼
身穿日内瓦袍的牧师，路德宗、改革宗等众多教派使用
身穿长白衣披戴圣带的牧师，起源自天主教，多为圣公宗、路德宗、循道宗使用
身穿圣衣 (宗教礼服)的牧师，起源自天主教，多为圣公宗、路德宗、循道宗使用
