林芳太郎(日语:はやし よしたろう、1889年10月3日 - 1963年6月8日)为日本陆军军人。最终阶级陆军中将。
京都府出身。1909年(明治42年)5月、陆军士官学校(21期)毕业。同年12月、任官步兵少尉。
1936年(昭和11年)8月、昇进步兵大佐任第10师团司令部付(第六高等学校配属将校)。1937年(昭和12年)12月、就任第17碇泊场司令官、1938年(昭和13年)7月异动、调为步兵第37联队长。
1939年(昭和14年)8月、进级陆军少将任东京陆军幼年学校付。1940年(昭和15年)3月、就任大阪陆军幼年学校长、1941年(昭和16年)3月、任北支那方面军隶下独立混成第7旅团长参与中日战争。
1942年(昭和17年)8月、进级陆军中将担任第110师团长、接续参与中国地区诸项作战任务。1944年(昭和19年)7月、就任近卫第3师团长。1945年(昭和20年)5月、任东部军管区付接着迎接终战。